靖难之役

明朝建立後，明太祖朱元璋為了鞏固自己及子孫的統治，便大封宗室二十五人為藩王，駐守全國各地。這些藩王雖然沒有封地的管治權，但擁有護衛軍隊，少者有三千人，多者至一萬九千人，駐守北方邊境的九位邊王（遼、寧、燕、谷、代、晉、秦、慶、肅）軍權更大，如寧王“帶甲八萬，革車六千”^[2]。

不过，在继承人问题上，朱元璋所立太子朱標早逝。皇太孫朱允炆是諸王之姪，感到難以制約各叔父們的勢力。加上諸王擁有軍權，對他構成潛在威脅，便有削藩之意。洪武三十一年（1398年）閏五月初十，明太祖朱元璋去世，朱允炆作為皇太孫繼位，是為惠帝（建文帝）。惠帝發布太祖遺詔，令諸王留於封地，不要赴都^[3]；甚至燕王朱棣已經前來奔喪，卻被惠帝命令返回，導致諸王不滿。惠帝於是與齊泰、黃子澄商量開始削藩^[4]。

朱允炆於洪武三十一年年閏五月繼位後，立即開始削藩。在削藩順序上，齊泰認為應先削實力最強的燕王，時戶部侍郎卓敬亦上疏請改燕王封地於南昌^[5]；但黃子澄反對，認為燕王有功無過，爲了爭取輿論支持，應該先找有問題的親王下手。惠帝支持黃子澄，遂先後廢除五位親王。

洪武三十一年七月，削周王。因周王是燕王同母兄弟，而朱允炆怕他與燕王呵成一氣，於是決定先廢周王。時周王十八歲的次子朱有爋告發父親謀反，於是派曹國公李景隆以備邊之名經過開封，將周王全家押回南京，廢為庶人，遷往雲南蒙化州^[6]（今雲南巍山）。

建文元年（1399年）四月，削齊、湘、代三位親王，廢為庶人。湘王不堪受辱，為保名節舉家自焚；齊王被軟禁在南京；代王被軟禁在封地大同^[7]。兩個月後，削岷王，廢為庶人，徙漳州^[8]。

由於惠帝削藩激化矛盾，藩鎮與中央開始決裂，此時實力最強的燕王就成了真正的諸王之首。而皇帝與朱棣之間的博弈亦逐漸走向明處，變得更加激烈。

惠帝朱允炆的削藩思想本身並無不妥，後來永樂帝、宣德帝亦持續打壓藩王勢力；但是由於缺乏政治經驗，惠帝過快地更改各方面政策，使得各種不良影響相互作用，導致其最終失敗。

在削藩中存在的主要問題有：

1. 削藩既無計劃（一月之內連削三王），又缺乏妥善的善後處理；加之惠帝本人剛剛登基，削藩速度過快，導致人心浮動。
2. 捕風捉影，導致地方有人告變邀功（如湘王被人誣告謀反，無以自明，遂自焚）。
3. 過於急躁，削廢并進，激化矛盾。西漢七國之亂、西晉八王之亂均非因置藩本身引起變亂，而是中央的削藩政策引發既得利益者抗爭；即使是七國之亂後，漢武帝也不是直接廢藩，而是頒佈《推恩令》來逐步削減。惠帝登基前，曾对明太祖说叔父们如果不服，将先德化，不成再用兵，得到太祖的认可。但惠帝登基后，為迅速削弱藩王實力，將五位親王全部直接廢除爵位，并加以迫害（流放或軟禁）。廢藩激化矛盾，使其他藩王為了自保而與中央對立，在戰爭爆發後袖手旁觀，甚至暗中援助燕王。
4. 掩耳盜鈴，放還燕藩三子。朱棣的三個兒子當時（建文元年五月）都在南京，本可作為人質，黃子澄卻說不如放回北平，以麻痹朱棣^[9][10]；但當時已削去四位藩王，實際上毫無欺敵之用，可謂掩耳盜鈴。

此外，在內政方略中亦存在嚴重缺陷，直接或間接導致其後來的軍事失利：

1. 重用文官，並行改制。太祖晚年大殺滅元功臣，加上惠帝重文抑武，導致其倚重者均為文官儒生。削藩的同時，惠帝進行改制，大幅提升文官地位；這使得惠帝在對內施政中難以獲得全面支持，對外作戰時還要顧慮武將的忠誠，造成極大的不良影響。
2. 輕視武將，罔顧軍事。惠帝本人毫無作戰經驗，又倚重文官決定軍事政策（如至關重要的統帥任命），使武將無法發揮應有的作用。此外，太祖的國策即為親王守邊，防止蒙古南侵，在沒有合適的替代者時，唐突削藩並非治國良策，武将担心会重返宋朝重文抑武的国策，導致国家積弱，後來的事實也證明如此，方孝孺等大臣確無保家衛國之作戰能力。
3. 無視宦官，變生肘腋。由於太祖的影響，惠帝對宦官十分嚴厲，導致宮人怨聲載道，甚至投奔敵方，洩露關鍵情報給燕王。

洪武三十一年十二月，為了提防燕王謀反，朱允炆派工部侍郎張昺為北平布政使，都指揮使謝貴、張信為北平都指揮使。隨後又命都督宋忠屯兵駐開平，并調走北平原屬燕王管轄的軍隊。

燕王朱棣見到幾位親王先後被削藩，或貶或死，明白如此下去必定無法逃過此劫，遂一邊爭取時間一邊做戰爭準備。爲了爭取時間，建文元年，朱棣先裝病，使惠帝放三子回北平；之後由於屬下被朝廷處死，遂藉機裝作精神失常。但由於王府長史葛誠叛變，密奏朝廷「燕王無病」，朱棣裝瘋被發覺^[11]。

時燕王遣使入京師金陵奏事，使者被齊泰等審訊，被迫供出燕王的異狀，於是朝廷下密旨，令張昺、謝貴逮捕燕王幕府的官屬，張信逮捕燕王本人。但張信與其母親討論之後，將此事告知朱棣^[12]。於是朱棣和僧人姚道衍等謀劃舉兵，令張玉、朱能將八百勇士帶入府中潛伏，以待變故^[13]。

張昺、謝貴得到朱允炆密詔后，七月初四帶兵包圍了燕王府。朱棣假意將官屬全部捆縛，請二人進府查驗。二人進府後，朱棣派出府內死士將其擒獲，并連同府內叛變的葛誠、盧振一同處決^[14]。當日夜裡，朱棣攻下北平九門，遂控制北平城^[15]。

燕王朱棣起兵造反，援引《皇明祖訓》^[16]，號稱清君側，指國君身邊的齊泰和黃子澄為奸臣（謀害皇室親族），需要鏟除，稱自己的舉動是，為國「靖難」（意為「平定國難」，「靖」為「靜」異體字），并上書於惠帝朱允炆。

燕軍控制北平后，七月初六，通州主動歸附；七月初八，攻破薊州，遵化、密雲歸附；七月十一，攻破居庸關；七月十六，攻破懷來，擒殺宋忠等；七月十八，永平府（今河北盧龍縣，屬秦皇島市）歸附。七月二十七，為防止大寧軍隊從松亭關偷襲北平，用反間計使松亭關內訌，守將卜萬下獄。至此，北平周圍全部掃清。燕軍兵力增至數萬^[17]。

燕軍攻破懷來後，由於領地相距太近，七月二十四日，谷王朱橞逃離封地宣府（今屬張家口，距北京約150公里，距懷來約60公里），奔金陵^[18]。八月，齊泰等顧慮遼王、寧王幫助燕王，建議召還京師；遼王從海路返京，而寧王不從，遂削寧王護衛^[19][20]。

宋忠失敗後，部將陳質退守大同。代王本欲起兵呼應朱棣，被陳質所控制，未果^[21]。

七月，朱棣反書至都，朱允炆祭告太廟，削朱棣宗室屬籍，廢為庶人。決定起兵討燕^[22][23]。在真定（今河北正定）設置平燕布政司^[24]。

建文帝削燕属籍诏
元年八月，帝乃祭告天地宗庙社稷及江淮旗纛之神，书谕诸王削燕属籍，命礼部侍中黄观草诏。诏曰：朕奉先皇帝遗诏，纂承大统，宵衣旰食，思图善政，以安兆民。岂意国家不幸。骨肉之亲屡谋僭逆。去年周庶人橚，潜为不轨，辞连燕、齐、湘三王，皆与同谋。朕以亲亲之故，不忍暴扬其恶，止治橚罪，餘置不问。今年齐王榑谋逆事觉，推问犯者，又言与燕王棣、湘王柏同谋大逆，柏自知罪恶难逃，自焚死，榑已废为庶人。朕以燕王棣于亲最近，未忍穷治其事。今棣乃忘祖逆天，称兵构逆，意欲犯阙，危宗社。悖逆如此，孰不骇闻？昔先皇帝时，棣包藏祸心，为日已久。印造伪钞，阴结人心，朝命穷极，藏匿罪人，先帝震怒，遂以成疾。至于升遐，海内闻知，莫不痛忿。今不悔过，又造滔天之恶，虽欲赦之，而获罪宗社、天地不容。已告太庙废为庶人，遣长兴侯耿炳文等率兵三十万往讨其罪。咨尔中外臣民军士，各宜怀忠守义，奉职平燕，与国同心，永安至治。布告天下，咸使闻知。^[25]

由於朱元璋晚年誅殺了不少良將，導致惠帝手下缺乏將才可用^[26]，朝廷只得任命65歲老將耿炳文率兵北上討伐，號稱三十萬人，實際先行率領十三萬人出兵。在臨行時，朱允炆親自告誡：「毋使朕有殺叔父名。」^[27]

耿炳文率軍在八月十三日到達真定^[28]，并分兵於河間、鄚州（河北任丘北约30里）、雄縣，為犄角之勢。在經過觀察後，八月十五日，燕軍趁中秋夜敵軍不備，偷襲雄縣；成功後又利用伏擊擊敗了鄚州的援兵，遂攻克鄚州，收編剩餘的部隊^[29]。

耿炳文部將張保來降，告知朱棣耿炳文的部隊分駐滹沱河兩岸，於是朱棣讓他回去告訴耿炳文「雄縣、鄚州大敗，燕兵將至」，以打擊其士氣，并使耿炳文合兵一處，便於一舉擊潰。耿炳文果然將南岸的兵調過河^[30]。

八月二十四日，燕軍到達無極縣。從樵夫和中央軍被俘士兵處得知敵情，於是燕軍發動決戰^[31]。

二十五日，燕軍趁耿炳文送使臣出城時偷襲中央軍，炳文逃回城中后，怒而迎戰。在燕軍主力與耿炳文軍相持時，朱棣親自率軍襲擊其側翼，耿炳文大敗潰逃；朱能帶三十餘騎沖入中央軍陣中，所向披靡，中央軍投降三千多人^[32]。中央軍狼狽逃回城中，城池差點失守。部將李堅、寧忠、顧成等被俘；士兵被殺、被俘數萬人（后放還）^[33]。

耿炳文率殘部不到十萬人在真定堅守不出，燕軍攻城三天不克。八月二十九日，燕軍返回北平^[34]。顧成降燕之後，留在北平協助燕世子朱高熾守城^[35]。

一说耿炳文当时即战死沙场（详见本人条目）。

耿炳文戰敗的消息傳到南京，朱允炆開始擔憂戰事，考慮換將。黃子澄說曹國公李景隆是名將李文忠之子，建議他接任；齊泰反對，但惠帝不聽^[36]。八月三十日，拜李景隆為大將軍，誓師出征，并召回耿炳文。李景隆以德州為大本營，調集各路兵馬包括耿炳文敗兵，增兵至五十萬人，九月十一日進至河間^[37]。

朱棣聽說朝廷以五十萬傾國之兵交付李景隆，大喜過望，說趙括之失必然重演，燕軍必勝^[38]。并提出李景隆之五敗^[39]：

一、為將政令不脩，紀律不整，上下異心，死生離志。

二、今北地早寒，南卒裘褐不足，披冒霜雪，手足皸瘃，甚者墮指，又士無贏糧，馬無宿槁。

三、不量險易，深入趨利。

四、貪而不治，智信不足，氣盈而愎，仁勇俱無，威令不行，三軍易撓。

五、部曲喧嘩，金鼓無節，好諛喜佞，專任小人。

九月初一江陰侯吳高率遼東兵攻打永平府^[40]，故朱棣趁李景隆躊躇不決之際，九月十九日前往救援。九月廿五，擊敗吳高，決定趁勢偷襲大寧（今內蒙古寧城）以獲得其精銳部隊；另一方面利而誘之，將中央軍引至「空城」北平下。九月廿八，出師。傳信給燕世子朱高熾，令堅守^[41]。

十月初六，燕軍經小路到達大寧城下。《明史》《明通鉴》载：朱棣單騎入城，見寧王朱權，哭訴自己無路可走，向朱權求救，希望能向朝廷上書，謝罪免死。朱權相信并收留了他。在居大寧期間，朱棣令手下吏士入城結交并賄賂大寧的軍官等。十月十三，朱棣提出告辭，朱權在郊外送行；但朱權來到郊外后，伏兵盡起，大寧軍紛紛叛變，歸附朱棣，守將朱鑑不能抵挡，力戰而死，寧府長史石撰不屈而死。於是朱權與王妃、世子等一同隨朱棣前往北平，而大寧的全部軍隊（包括其騎兵精銳朵顏三衛）都被朱棣收編。大寧成為空城。朱棣實力大增^[42]。而《明实录》载，宁王朱权因抗命不回朝被削夺护卫囚禁，朱棣突袭大宁，守军仓促关门守御，城墙崩塌，朱棣指挥勇士先登破城，俘获都指揮房寬，这才救了被囚禁的朱权；被削夺但仍留在城中的宁王护卫这时候也都归附，朱棣把他们都还给宁王^[43]。

聽說燕王朱棣率精銳徵大寧，李景隆引軍攻北平。中央軍在鄭村壩（今大興以東二十里）紮營，築壘同攻北平九門。燕王世子朱高熾堅守。朱高熾遣人夜間偷襲中央軍大營，獲得了一定的喘息時間；中央軍攻城急時，城中婦女也上城頭向下投擲瓦石^[44]。

中央軍唯一一次獲勝的機會是都督瞿能攻張掖門（一說彰義門，據《方輿紀要》，彰義門即西直門；存疑）^[45]，幾乎要攻下時，因被李景隆所忌，只得停止。功敗垂成。農曆十月北平甚寒冷，於是燕軍守城部隊夜裡汲水澆于城牆上，次日城牆結冰，無法攀登^[46]。中央軍因天寒地凍，戰鬥力驟降，攻勢自此受阻^[47]。

十月十九，燕軍在會州整編，分立五軍（中前左右後）。十月廿一，入松亭關^[48]。

十一月初五，渡白河（時已結冰，渡河處在今北京順義區東），并打敗李景隆的哨探陳暉部隊萬餘人^[49]。當天，與李景隆大軍在鄭村壩會戰。燕軍左右衝擊，連破其七營，李景隆大敗^[50][51]。當夜，李景隆見戰事不利，令鄭村壩所有軍隊輕裝撤退。數十萬人的輜重全部留給了燕軍^[52]。但李景隆走得匆忙，沒有通知圍攻北平城的軍隊，於是燕軍輕易擊潰城下的敵軍，獲得其物資^[53]。李景隆率軍撤回德州，鄭村壩之戰結束^[54]。此戰中央軍喪師十餘萬^[55]。

十一月初九，朱棣回到北平城，因為之前（七月）上書沒有回信，再次上書朝廷，陳述齊、黃構陷宗藩。朱允炆不應^[56]。十二月，朱棣用反間計令遼東守將吳高被削爵貶黜，消除東北方向的後顧之憂^[57]。

由於李景隆準備等來年開春再北上攻燕，朱棣決定攻打大同，以使中央軍疲於奔命。十二月十九日，出師攻大同。十二月廿四，抵達廣昌，守將楊宗投降^[58]。建文二年（1400年）正月初一，燕軍抵達蔚州，守將王忠、李遠投降^[59]。二月初二，燕軍攻大同。由於大同是代王封地且軍事地位極重要，李景隆不得不救援。待李景隆走出紫荊關后，燕軍從居庸關返回北平。中央軍在冰天雪地中白跑一趟，兵力、裝備大量損失，士氣受到重創^[60]。

二月廿八，李景隆給朱棣寫信，請求暫時停戰。燕王回信索要齊泰、黃子澄等。一說李景隆自此有貳心^[61]。

除了使中央軍白跑了一個月外，燕軍在本次伐大同時意外遇到了從蒙古來降的軍隊，收編之^[62]。此外，保定府於建文二年二月降燕^[63]。

建文二年四月，李景隆從德州，郭英、吳傑等從真定誓師北伐，目標是白溝河（北拒馬河）。兵力增至六十萬。燕軍亦出。四月二十日，燕軍渡過玉馬河，駐於蘇家橋^[64]。四月廿四，與中央軍會戰（戰場在河北省高碑店市新城縣南三十里）。

中央軍（李景隆部）先鋒平安之前曾跟隨朱棣出塞，熟悉朱棣戰法，設伏兵；燕軍至，平安伏兵起，挺矛衝鋒；瞿能父子也一同合擊，燕軍戰鬥失利。時中央軍（郭英部）也來到戰場，郭英在燕軍撤退的必經之路上埋地雷，燕軍撤退時損失慘重。朱棣親自率軍殿後，但夜間迷失了道路。朱棣下馬趴在地上辨別河流的方向，才分清方向，回到大營。令軍士提前用餐，準備次日決戰^[65][66]。

四月廿五，再次合戰。瞿能、平安繞至燕軍後方，攻其後軍，得手^[67]。朱棣見狀不好，親冒矢石，令丘福衝擊李景隆中軍，不成功；朱棣率軍攻打，雙方混戰，飛矢如雨。朱棣先後換了三匹馬，射光了三筒箭，寶劍也砍斷，差點被平安、瞿能所傷。無奈之下，朱棣來到河堤上，舉起馬鞭，假裝招呼援兵，李景隆見狀果然生疑，攻勢減緩；朱高煦此時也來援救，戰事暫時緩和^[68][69]。

不久，瞿能再次引眾搏戰，大呼「滅燕」，形勢再次對燕軍不利。就在戰事危急時，一股旋風刮起，刮斷了李景隆的帥旗，中央軍頓時大亂。朱棣抓住機會，繞到李景隆後方放火。中央軍大敗，瞿能父子被朱高煦陣斬^[70]。郭英等向西撤退，李景隆向南撤退，輜重全部扔下，投降十萬餘人。李景隆撤回德州^[71][72][73]。

四月廿七，燕軍進攻德州。五月初七，李景隆逃往濟南。初九，燕軍進入德州，獲得大量糧食儲備。五月十五，燕軍攻濟南，李景隆殘存十餘萬兵毫無戰鬥力，大敗。李景隆逃走。燕軍遂圍濟南^[74]。

十月，朝廷召李景隆回南京。李景隆把五十萬大軍幾乎賠的乾淨，黃子澄、練子寧、葉希賢等上書，請求立斬之，朱允炆不聽。對於推薦了李景隆，黃子澄感到十分後悔^[75]。

鄭村壩之戰和白溝河之戰後，李景隆將朝廷賦予的五十萬兵馬賠得一塌糊塗，中央軍與燕軍自此攻守形勢逆轉。

李景隆敗退后，燕軍圍濟南。右參政鐵鉉、盛庸堅守。朱棣射信入城招降，未果^[76]。

五月十七，燕軍掘開河堤，放水灌城^[77]。鐵鉉見勢不妙，決定派千人詐降，誘朱棣進城^[78]。次日，朱棣前往濟南，走到城門口時，城門預設的鐵板落下，但略快了些，只打中了其所乘馬的頭。朱棣大驚，換馬跑回。由於事出意外，斷其後路等工作沒能成功。朱棣逃回，大怒，圍城攻打三個月^[79]。

由於濟南的軍事地位極重要，若取得濟南，進可南下攻打，退可畫疆自守，故燕軍乘新勝之銳氣，志在必得。不料攻城不利，朱棣憤怒之下決定使用大砲攻城，城中不支。鐵鉉見狀，在一些木板上寫了「高皇帝神牌」字樣并掛在城頭，燕軍只得停止砲擊^[80]。

六月，朱允炆見濟南危急，遣使求和。朱棣不聽^[81]。七月，平安進軍河間，擾亂燕軍糧道^[82]。朱棣進退不得，八月十六，撤兵回北平。盛庸、鐵鉉追擊，大敗燕軍，收復德州^[83]。濟南之戰結束。

九月初十，朱允炆升鐵鉉為山東布政使，參贊軍務，不久后升兵部尚書；封盛庸為歷城侯，平燕將軍，撤換李景隆。都督陳暉、平安為副職。中央軍重新進到德州、定州（今保定與石家莊之間）、滄州（今河北滄州）^[84]。

建文二年十月，朱棣聞報中央軍北上，決定在敵軍落腳未穩時，襲取滄州，再度南下。於是明令征遼東，暗中派人在直沽（今天津市中心）修建浮橋。十月廿五，從通州折向南，晝夜兼行，十月廿七到達滄州，守將徐凱尚在築城中；燕軍僅用兩天就攻下滄州，徐凱等投降^[85][86]。燕軍自長蘆渡河^[87]，十一月初四到達德州。朱棣招降盛庸未果，遂南下；盛庸襲擊燕軍後軍，失敗^[88]。十一月，燕軍到達臨清；朱棣決定擾亂中央軍的糧道，遣輕騎至大名，焚其糧船。燕軍從館陶渡河（衛運河，京杭運河的一部分；當時黃河奪淮入海），先後到達東阿、東平，威脅南方，迫使盛庸南下^[89]。盛庸將計就計，決定在東昌（今山東聊城）決戰，並在陣中擺了大量火槍和毒弩^[90]。

十二月廿五，燕軍至東昌^[91]。朱棣仍然親自率軍衝鋒，先衝擊其左翼，不動；然後又衝擊其中堅，盛庸開陣將朱棣誘入，然後合圍。朱棣被重重包圍，燕軍張玉、朱能（一說還有朱高煦^[92]）分別引兵來救，朱棣死戰，終於和朱能會合，逃離戰場。大量燕軍被火器所傷，張玉被中央軍包圍，戰死。平安亦率兵趕來，與盛庸合兵作戰。次日，燕軍再次戰敗，遂北還^[93]。在擊退中央軍的阻截後，建文三年正月十六，燕軍返回北平^[94]。張玉戰死，朱棣十分悲傷^[95][96]。

東昌之戰，朱棣多次瀕臨險境。但是由於朱允炆有「毋使朕有殺叔父名」旨意，中央軍將士懼怕戰後反攻倒算，既不敢傷害朱棣，又難以活捉，只得放任自由；朱棣也恃此特權，單騎殿後，中央軍無可奈何^[97]。

東昌之戰是靖難以來中央軍的第一場大捷。惠帝朱允炆十分高興，建文三年（1401年）正月恢復了齊泰、黃子澄的官職（建文元年十一月兩人被罷免，但仍作為智囊留用^[98]；至是恢復齊的兵部尚書和黃的太常寺卿職務）^[99]，並以東昌大捷告太廟^[100][101]。盛庸軍勢大振，燕軍經此敗，以後再南下，皆由徐沛，不再走山東^[102]。

朱棣以東昌之敗為恥，與姚道衍商議。道衍強烈支持再次出兵^[103]。於是於建文三年二月初九，祭陣亡將士，朱棣脫下袍子燒掉，激勵軍士；二月十六，再次出師^[104]。時盛庸駐兵二十萬於德州，吳傑、平安在真定。朱棣決定趁其兩軍分隔，先破盛庸^[105]。三月二十日，燕軍探知盛庸在夾河（今河北省衡水市武邑縣附近，漳河支流）駐紮，於是駐紮在距對方四十里的地方^[106]。

三月廿二，燕軍進兵夾河。盛庸仍結下堅陣，備大量火槍強弩；朱棣利用建文的禁殺之旨，親自率幾個輕騎兵掠過敵陣偵查。盛庸不敢開槍，只得派出自己的騎兵追趕，不了了之^[107][108]。偵查后，朱棣率領一萬騎兵和五千步兵攻擊盛庸軍左翼，不能入。此時燕將譚淵望見已經開戰，於是主動出兵攻打。盛庸部將莊得死戰，會合盛庸軍，斬殺譚淵。朱棣、朱能等則趁南軍調動產生的混亂，趁暮色向南軍後方猛攻，斬殺莊得^[109]。盛庸穩住了陣腳，天色已晚，雙方罷兵。此戰殺傷相當，但燕軍損失了大將譚淵^[110]。

當夜，朱棣率領十餘人在盛庸營地附近露宿；三月廿三清晨，發現被中央軍包圍。朱棣再次利用禁殺之旨，引馬鳴角，穿過敵軍，揚長而去。中央軍愕然，不敢射箭^[111]。

朱棣回到營中，鼓勵眾將「兩軍相當，將勇者勝」^[112]，於是燕軍在東北方向，盛庸軍在西南方向，再次會戰。燕軍左右衝擊，盛庸堅守，雙方互有勝負。戰鬥打了三四個時辰后，突然刮起了強烈的東北風，塵埃蔽天。中央軍頂著風沙，根本沒法作戰；燕軍則乘風大呼，縱左右翼橫擊之，盛庸大敗，損失了數萬人后，退回德州^[113][114]。吳傑、平安引兵準備會合盛庸，聞庸已敗，退回真定^[115]。夾河之戰結束。

夾河之戰重新確立了燕軍的優勢。閏三月初四，朱允炆因夾河之敗，再次罷免齊泰、黃子澄，謫出京城，暗中令其募兵^[116]。

擊敗盛庸后，朱棣進軍真定。考慮到攻城較困難，決定誘敵出戰。於是下令軍中四出取糧，而用間諜向吳傑等透露此事。吳傑等見狀，決定襲擊之^[117]。閏三月初九，兩軍會於藳城，遂交戰。中央軍列方陣，朱棣則率精銳攻其東北角以破陣。燕將薛祿由於馬失足被擒，但奪敵刀斬數人后，奪馬逃走。此戰大量燕軍被中央軍的火槍和弓弩所傷，朱棣的帥旗被射得像刺猬一樣；但是，由於朱允炆的禁殺之旨，朱棣本人反而沒事^[118]。

次日，復戰。在戰鬥中突然又刮起了猛烈的大風，中央軍不能支，大敗而去。燕軍四面圍攻，斬首六萬餘級。吳傑、平安等逃回真定，堅守不出^[119]。朱棣將射成刺猬的軍旗送回北平，令世子朱高熾妥善保存，以警示後人^[120]。

從白溝河、夾河到藳城，燕軍三次得大風相助而勝，朱棣認為這是天命所在，非人力所能為^[121]。

夾藳之戰再次使南軍損失慘重，正面戰場戰事稍緩和。中央軍改為通過談判、反間、襲擊後方等方式間接作戰。

擊敗平安後，燕軍南下，先後經過順德、廣平、大名，并駐紮於大名。諸郡縣望風而降^[122]。

朱棣聽說齊黃被貶，上書和談，表示「聽說奸臣雖然被貶了，臣也打算退兵回燕國，但吳傑、平安、盛庸之眾，還聚在我國境之上，這是他們的計策還在實行，臣不敢奉旨撤兵」^[123]。朱允炆得書，與方孝孺討論，方孝孺表示可以借此機會遣使回報，拖延時間，并懈怠其軍心；同時令遼東等軍隊攻其後方，以備夾攻。於是（四月）惠帝令大理寺少卿薛嵓去見朱棣，傳詔并秘密在軍中散佈相關消息^[124]。薛嵓見朱棣，說：「朝廷說殿下早上脫下了盔甲，下午就退兵。」朱棣表示這種謊言，連三尺小兒也騙不過。薛嵓害怕，無言以對^[125]。五月初一，盛庸、吳傑、平安等分兵騷擾燕軍餉道^[126]。朱棣遣使者進京表示盛庸等不肯罷兵，必有主使。惠帝聽從方孝孺的意見，將來使下獄（一說誅殺）^[127][128]，和談破裂。

朱棣見和談破裂，決定襲擊中央軍餉道，以使德州南軍陷入困境，遂令都指揮李遠率兵六千，換穿中央軍甲胄，從濟寧南下；六月十五，瞞過中央軍到達沛縣，成功焚燒大量中央軍糧船，河中魚鱉盡死。中央軍損失糧食數百萬石，京師大震，德州陷入窘境^[129]。

七月，燕軍進攻彰德，林縣投降^[130]。七月初十，平安自真定趁虛攻北平，擾其耕牧。朱高熾固守。朱棣分兵回援；（九月十八）平安與戰不利，退回真定^[131]。

由於河北戰事不利，方孝孺想出了反間計，利用朱高熾（長子）和朱高煦（次子）的矛盾，先寫一封信給守北平的高熾，令其歸順朝廷，許以燕王之位；然後派人告訴朱棣和高煦（隨軍）世子密通朝廷，以使燕軍北還。但朱高熾得到信後，根本沒有拆開，將朝廷使者連人帶信一起送往朱棣處。反間計失敗^[132]。

七月十五，盛庸令大同守將房昭入紫荊關威脅保定，據易州西水寨以窺北平。朱棣見狀，只得回兵救援^[133]。朱棣分兵守保定，并包圍房昭的山寨。十月初二，燕軍與真定援兵和房昭軍決戰，朱棣令勇士悄悄登山，在敵後大張旗幟。中央軍山寨見狀大亂，與真定援兵一齊崩潰。房昭退回大同^[134]。

十月廿四，燕軍回到北平。之後又擊敗了襲永平的遼東敵軍^[135]。

至此，燕軍靖難已有兩年多。雖然屢戰屢勝，但因兵力不足，無法鞏固並擴張勝利，往往放棄新取之地；僅能據有北平、保定、永平三個郡^[136]。

建文三年冬，朱棣決定直接率兵南下直撲南京，臨江一決。道衍亦支持不再與盛庸、平安等糾纏，直趨京師^[137][138]。

十二月初二，燕師復出。十二月十二，到達蠡縣（約在保定以南50公里）。建文四年（1402年）正月，先後擊敗德州的一支分隊和平安的部隊，於是燕軍南下（路線大致位於現京九鐵路和京廣鐵路之間）至館陶渡河（進山東），并長驅直入。正月十二，館陶渡河；正月十四，陷東阿；正月十五，陷東平；正月十七，陷汶上；正月廿七，陷沛縣（進江蘇）；正月三十，到達徐州^[139]。

惠帝見燕軍再次出動，三年十二月令駙馬都尉梅殷（惠帝的姑父，顧命大臣）任總兵官，鎮淮安^[140]。建文四年正月初一，將遷往蒙化的朱橚（廢周王）召回南京。命魏國公徐輝祖率兵援山東^[141]。

二月初一，何福、平安、陳暉進兵濟寧，盛庸進兵淮上。朱棣派兵襲擊中央軍餉道後，二月廿一，擊敗徐州的出戰軍隊，徐州自此閉城死守^[142]。

徐州堅守不出，朱棣遂不再理會，繼續南下。三月初一，燕軍進逼宿州。三月初九，抵達渦河（今安徽蚌埠市懷遠縣以北）^[143]。平安見到燕軍一路南下，帶兵來追；但三月十四日在淝河中了朱棣所設的伏兵，只得退回宿州^[144]。三月廿三，朱棣遣將斷徐州餉道，鐵鉉等率兵圍攻，互有勝負^[145]。四月十四，燕軍進達睢水之小河，搭浮橋。次日，平安、何福領軍奪橋，雙方隔河僵持。數日後，中央軍糧盡，朱棣決定偷襲。半夜，渡河繞至敵後；但徐輝祖援兵正好趕到，四月廿二，雙方戰於齊眉山（靈璧縣西南三十里），中央軍大勝，斬燕將李斌^[146]。

中央軍再次獲得勝利，再加上暑熱，燕軍陷入窘境。四月廿三，燕軍眾將要求北返，擇地休整，朱棣不同意，說「欲渡河者左，不欲者右。」大部份人站於左側，朱棣怒。朱能這時強力支持朱棣，表示「漢高祖十戰九不勝，卒有天下」，堅定了燕軍堅持的決心^[147]。

這時，朝廷訛傳燕軍已兵敗，京師不可無良將，遂召回徐輝祖^[148]。四月廿五，考慮到在河邊不易防守，何福移營，與平安在靈璧深溝高壘作長遠之計。由於糧道被燕軍阻礙，平安親自率兵六萬護衛糧草。四月廿七，朱棣率精銳襲擊平安，將其一分為二；何福全軍出動救援，朱高煦也率伏兵出現，何福敗走^[149]。

中央軍缺糧，何福與平安決定次日（廿九）突圍而出，在淮河取得給養，號令為三聲炮響；次日，燕軍攻打靈璧墻壘，進攻信號正巧也是三聲炮響。於是中央軍以為是己方號炮，紛紛奪路而逃；燕軍趁勢進攻，中央軍全軍覆沒。靈璧之戰就此意外結束。此戰燕軍生擒了陳暉、平安、馬溥、徐真、孫成等三十七員敵將，四名內官（宦官），一百五十員朝廷大臣，獲馬二萬餘匹，降者不計其數。只有何福單騎逃走^{[150][151][152]}。

靈璧之戰徹底擊潰了中央軍主力，此後燕軍在長江以北再也沒有遇到像樣的抵抗。一千六百年前決定楚漢之爭勝敗的垓下之戰就發生在靈璧附近，可謂歷史的巧合。

按照齊黃的策劃，曾令遼東派兵南下欲與鐵鉉會師濟南，但五月初一在直沽被燕軍擊潰。

靈璧之戰後，燕軍向東南方向直線前進。五月初七下泗州，朱棣到祖陵祭祖^[153]。盛庸在淮河設下防線阻礙燕軍渡河，朱棣在嘗試取道淮安、鳳陽受阻後^[154]，遣朱能、丘福率士兵數百人繞道上游乘漁船渡河，五月初九從後方突襲盛庸，盛庸敗走。燕軍遂克盱眙^[155]。

五月十一，燕軍向揚州方向前進，五月十七到達天長（揚州西北50公里）。守揚州的監察御史王彬本想抵抗，但屬下徐政、張勝反叛，趁其沐浴時綁縛之。五月十八，揚州不戰而降^[156]。隨後高郵歸降^[157]。同月，镇守泗州的指挥周景初投降燕军，当时在泗州的原辽王府典宝郭铭自杀殉国。

揚州失陷，金陵震動。朱允炆驚慌不已，與方孝孺商議後，先後定下如下幾個救急方法：下罪己詔；號召天下勤王；派練子寧、黃觀、王叔英等外出募兵；召回被貶黜的齊泰、黃子澄；遣人許以割地求和，拖延時間^[158]。方孝孺的幾個辦法中，只有兩個起到了效果：齊黃被召回（外出募兵，未進京），蘇州、寧波、徽州等地知府先後率兵進京師^[159]。

五月廿二，朱允炆遣慶成郡主（朱元璋的侄女、朱棣的堂姐）與朱棣談判，表示願意割地。朱棣說：「這是奸臣打算暫時延緩我進兵，要等遠方的救兵而已。」郡主無言以對，遂返^[160][161]。

六月初一，燕軍準備從浦子口渡江，但遇到了盛庸最後的抵抗。燕軍戰不利，朱棣打算議和北還。此時朱高煦引兵來援，朱棣非常高興，拿著節鉞，拍著他的背說：「努力罷！世子常常生病啊。」暗示朱高煦有機會取得儲君寶座，於是朱高煦大受鼓舞，率眾殊死戰，擊敗盛庸^[162]。隨後中央軍的一支水軍部隊降燕^[163]，燕軍遂於六月初三自瓜洲渡江，并再次擊敗退守此地的盛庸。六月初六，燕軍至鎮江，守將率城投降^[164]。

六月初八，燕軍駐紮於龍潭（距京師金陵東約30公里），朝廷大震。朱允炆徘徊殿間，召方孝孺問計。有人提議逃往內地以圖興復，方孝孺表示城中尚有二十萬兵，應堅守待援；即使真戰敗，國君為社稷而死，是理所應當的。可以再派大臣、在京諸王前往談判以拖延時間。於是六月初九，派李景隆、茹瑺等見朱棣，再次談判；朱棣表示割地無名，只要奸臣。六月初十，遣谷王朱橞（建文元年逃回京城）、安王朱楹等第三次前往談判，無果^[165]。

六月十二，外出募兵的大臣們仍未返回，朱允炆只得派在京諸王和武臣們守衛各門。時左都督徐增壽（徐達子，徐輝祖弟）謀內應，被一群文官圍毆^[166]。六月十三（1402年7月13日），燕軍抵金陵。徐增壽作內應，事敗，被朱允炆親自誅殺於左順門。守衛金川門（位於南京城西北面）的朱橞和李景隆望見朱棣麾蓋，開門迎降，是為金川門之變^{[167][168][169]}。

燕軍攻入金陵，江山易主。靖難之役結束。建文四年（洪武三十五年）六月十七日，朱棣登基即皇帝位，是為明太宗（後改成祖）。

燕軍進南京，朱允炆見事不可為，遂在皇宮放火。馬皇后死於大火，朱允炆本人及太子朱文奎不知所終；此後其下落成為謎團^[171]。

朱棣入城，派人找出馬皇后的屍體，指認其為朱允炆，并執其手哭「傻小子，何苦如此」^[172]，隨後六月廿日以天子禮葬之，造成朱允炆已死的假象^[173][174]。

南京陷落後，朱棣入城，就要進宮登基。翰林院編修楊榮迎於馬首，說：「殿下先去拜謁孝陵，還是先去即位？」點醒朱棣，應該對明太祖表示孝道^[175]。次日（建文四年六月十四）起，諸王及文武群臣多次上表勸進，朱棣不允^[176]。數日後（六月十七），朱棣謁孝陵，并於當日即皇帝位^[177]是為明太宗（後改為成祖）。重建奉先殿（舊殿為朱允炆所焚），刻玉璽^[178]。同年十一月十三日，封王妃徐氏為皇后^[179]。

朱棣不承認建文年號，七月初一（一說六月十八），將建文元、二、三、四年改為洪武三十二至三十五年^[180][181]，次年改为永樂元年。凡建文年間貶斥的官員，一律恢復職務（如靖難初期因離間被貶的江陰侯吳高被再次起用，守大同）；建文年間的各項改革一律取消^[182][183]；建文年間制定的各項法律規定，凡與太祖相悖的，一律廢除。但一些有利於民生的規定也被廢除，如建文二年下令減輕洪武年間浙西一帶的極重的田賦，至此又變重。^[184]

朱棣在靖難之役結束后向金陵軍民發布公告稱：「諭知在京軍民：我本欲永遠守衛我的藩封，卻因奸臣弄權，作威作福，導致皇家骨肉被其殘害，不得不起兵誅殺之，目的是扶持社稷和保全親藩。現在平定京師，有罪的奸臣不敢赦免，無罪者也不敢濫殺；如有小人藉機報復，擅自綁縛、放縱、掠奪等而禍及無辜，非我本意。」^[185]

建文四年六月廿五，朱棣誅殺齊泰、黃子澄、方孝孺，滅其族^[186]。其中方孝孺據傳被誅十族（九族加朋友門生）^[187]，因方孝孺而被受牽連而死者共873人，充軍等罪者千餘人^[188]。因黃子澄受牽連的有345人^[189]。景清降後密謀行刺，事敗，八月十二被殺，滅九族；後屠其家鄉，謂「瓜蔓抄」^[190][191]。

此外，眾多建文舊臣如卓敬、暴昭、練子寧、毛泰、郭任、盧植、戴德彝、王良、王叔英、王敬止、謝升、丁志方、甘霖、董鏞、陳迪、陳繼之、韓永、葉福、劉端、劉璟、鐵鉉、侯泰、黃觀、廖昇、周是修、顏伯瑋、茅大芳等等也都被處決或自盡，史稱：「忠憤激發，視刀鋸鼎鑊甘之若飴，百世而下，凜凜猶有生氣。」^[192]他們的家屬和親人也被牽連，死者甚眾。被流放、逼作妓女及被其它方式懲罰的人也不少^[193]。明仁宗即位後，大部份人始獲赦免，而餘下的人的後代卻遲至明神宗時始獲赦免^[194]。建文遜位，朝野為之盡忠死節者甚眾，不及備載。

在大肆誅殺之外，當月，朱棣將魏國公徐輝祖禁錮，後釋放并削其爵位。輝祖死後，其子嗣魏國公爵^[195]。黃觀被朱棣所嫉恨，其狀元的身份被革去，故明代保持連中三元，受記錄的只有商輅一人。盛庸、平安（靈璧之戰降）、何福、駙馬梅殷等先後投降。朱棣的左都御史陳瑛亦迫害建文舊臣及其家眷。

靖難之役，文武眾臣出力甚多，朱棣稱帝後先後進行了封賞。京城陷落後，六月十九，追封徐增壽為武陽侯，諡忠湣，後進為定國公，世襲^[196]。靖難將士各有封賞。

九月初四，論功行賞，大封眾將^[197][198]。

封公（2人，追封2人；省略除封爵外的其他封賞，下同）：

• 丘福：淇國公，子孫世世承襲（以下簡稱世襲）
• 朱能：成國公，世襲
• （追封）張玉：榮國公，諡忠顯
• （追封）陳亨：涇國公，諡襄敏

封侯（13人，追封2人）：

• 張武：成陽侯，世襲
• 陳圭：泰寧侯，世襲
• 鄭亨：武安侯，世襲
• 孟善：保定侯，世襲
• 火真：同安侯，世襲
• 顧成：鎮遠侯，世襲
• 王忠：靖安侯，世襲
• 王聰：武城侯，世襲
• 徐忠：永康侯，世襲
• 張信：隆平侯，子孫世襲隆平伯
• 李遠：安平侯，子孫世襲安平伯
• 郭亮：成安侯，子孫世襲成安伯
• 房寬：思恩侯，子孫世襲指揮使
• （追封）譚淵：崇安侯，諡壯節
• （追封）徐增壽：武陽侯，諡忠湣

封伯（11人）：

• 徐祥：興安伯，世襲
• 徐理：武康伯，世襲
• 李浚：襄城伯，世襲
• 張輔：信安伯，世襲
• 唐雲：新昌伯，子孫世襲指揮使
• 譚忠（譚淵子）：新寧伯，世襲
• 孫岩：應城伯，世襲
• 房勝：富昌伯，子孫世襲指揮使
• 趙彝：忻城伯，世襲
• 陳旭：雲陽伯，世襲
• 劉才：廣恩伯，子孫世襲指揮同知

歸附并出力的建文舊臣封爵：

• 李景隆：仍為曹國公，增祿，世襲
• 王寧：永春侯，世襲
• 茹瑺：忠誠伯，不世襲
• 王佐：順昌伯，子孫世襲指揮使
• 陳瑄：平江伯，子孫世襲指揮使

各賜冠服，給誥券。

朱棣稱帝後，六月十八，恢復了周王朱橚、齊王朱榑的爵位^[199]。隨後恢復代王朱桂、岷王朱楩的爵位。永樂元年正月，令周、齊、代、岷四王歸藩^[200]。

六月廿六，朱棣取消朱標的明興宗廟號，重新稱懿文太子，吕太后复称懿文太子妃^[201][202]；七月十二，將朱允炆的三個弟弟由親王降為郡王^[203]；十一月以不能匡正建文帝为由將朱允熥、朱允熞廢為庶人软禁凤阳，朱允熙不久暴卒^[204][205]。朱允炆次子朱文圭亦被废为“建庶人”，软禁凤阳广安宫，55年后才和朱允熥后人一同被明英宗释放。朱标子孙再无任何人在生前获得任何宗室封爵。

朱棣因為反對建文帝削藩而起兵，爲了爭取諸王擁戴，即位后立即恢復了被削的藩王，并加以賞賜，甚至改變祖制給予宗室更高的品級。如按照洪武年間規定，鎮國將軍（郡王之子）為三品，輔國將軍四品，奉國將軍五品，鎮國中尉六品，輔國中尉七品，奉國中尉八品。而成祖「遂加鎮國將軍從一品，輔國將軍從二品，奉國將軍從三品，鎮國中尉從四品，輔國中尉從五品，奉國中尉從六品」^[206]。

然而由於朱棣自己是武裝奪權的，爲了保證中央政權穩固，他即位后先將諸邊塞王改封于內地，然後逐漸解除諸王的兵權：永樂元年削代王護衛及官屬；永樂四年削齊王護衛及官屬，不久廢為庶人；永樂六年削岷王護衛及官屬；永樂十年削遼王護衛；永樂十五年廢谷王為庶人；永樂十九年周王見勢不妙，主動獻還護衛。洪武朝帶兵的十三位親王，永樂朝削去了六個護衛。與此同時，大封靖難功臣，將大批有經驗的武臣保留下來，加強中央政權，從根本上改變了中央和諸藩的軍事力量對比^[207]。

雖然朱棣實現了朱允炆當年的目的，但只解決了眼前的問題，並沒有改變祖制；其子漢王朱高煦和趙王朱高燧仍然設立了三護衛。宣德元年，高煦之亂，再次證明親王統兵不是辦法。明宣宗親征平亂後，利用其威望，迫使絕大部份藩王交出了護衛，并從各個方面對宗室加以控制。此後，宗室與中央的矛盾逐漸由軍事上對政權的威脅，轉變為大量增加的俸祿對中央財政的壓力^[207]。例如弘治五年，曾有地方官員上奏朝廷，指一名宗室有九十多個子女，最後朝廷限制郡王以下正妃外妾的數量^[208]。明朝末年民變四起，單是福王朱常洵的財產，就已經成了李自成的軍隊在此之後幾年的軍費的來源。

由於洪武年間，北方的防務多由幾位邊王（如朱棣、朱權）負責，而靖難後朱棣徙諸邊王於內地，導致華北防務空虛；又由於有唐朝之守外虛內、宋朝之守內虛外的教訓，故在軍事上，定都金陵（南京）、遙控將領守衛邊界的風險很大；“天子守國門”則可以解決這一問題。另一方面，由於南京的建文帝勢力影響較大（很多建文遗臣始终不顺服朱棣統治），出于在政治上考慮，作為朱棣大本營的北平更加適合作為京师，再加上蒙古的軍事威脅，故考慮各種因素后，朱棣決定遷都北京。

永樂元年（1403年）冬二月，朱棣改北平府為北京，名順天府^[209]；隨後遷徙各地富民於北京^[210]。稱北京為行在。永樂年間，遷都北京的準備一直在進行，如建北京城、建宮殿、疏通漕運等；直到永樂十八年（1420年），北京皇宫和北京城建成，遂下令遷都，以南京作為留都^[211]。自此，除1928年至1949年期間國民政府定都南京外，北京一直是中國的首都，政治中心从此北移。

朱棣在靖難初始時曾將大寧的全部軍力（包括朵顏三衛）納入麾下，朵顏三衛在後續作戰中起到了重要作用；故朱棣稱帝後，將寧王封於南昌。对于大宁地区，有两种说法，其一认为朱棣在永樂元年三月把大寧封賞給朵顏三衛作酬勞^[212][213]。

大寧位於今日遼、蒙、冀三省交界處，遼東-薊州-宣府弓形的中心，軍事地位相當重要；洪武十三年（1380年）收復，并建立衛所，至此廢除^[214]。大寧可以作為遼東、薊州、宣府等地的防衛前哨，并影響其防衛效果；失去大寧，從關內到遼東就只能走山海關過錦州。此後（尤其是土木之變後），薊遼的戰事不斷。尤其是正統土木之變與嘉靖庚戌之變，蒙古人都從大寧入寇。割大寧之事，多為後人所詬病^[215]。

其二认为朱棣虽然内迁了大宁，永乐元年（1403年）三月初五日，“（北平）行都指挥使司为大宁都指挥使司，隶后军都督府，设保定左、右、中、前、后五卫，俱隶大宁都司。调营州左屯卫于顺义，右屯卫于苏州，中屯卫于平峪，前屯卫于香河，后屯卫于三河，卫设左、右、中、前、后五所，仍隶大宁都司”^[216]。但朱棣并未将大宁地区给予兀良哈作为酬劳，而仅仅是给予其更高的自治权，且不准他们南下大宁地区放牧，“今仍旧制，设泰宁、福余、朵颜三卫，俾尔等统属军民，镇守边境；旧尝授官者，列名以闻，咸复之。若头目人等，前未授官，于今当授者，亦第其名来闻，朕即授之，俾世居本土，安其生业”^[217]。明成祖还于永乐四年（1406年）和永乐二十年（1422年）对兀良哈蒙古进行镇压，以维持这一地区的稳定^[218]。

而大宁地区在永乐年间始终作为朱棣“今灭此残虏，惟守开平、兴和、宁夏、甘肃、大宁、辽东，则边境可永无事矣”^[219]边防体系的一部分发挥着作用，直到景泰之后，随着明朝边防政策转向保守，大宁地区才最终为兀良哈三卫占据。^{[220][221][222]}

爲了更有效率地處理國務，洪武三十五年（1402年）八月初一，朱棣令解縉、黃淮入直文淵閣，預機務。隨後擴充內閣至七人。從此內閣開始在明朝政治中發揮越來越重要的作用^[223]，甚至清朝仍沿用此制度。

另一方面，由於朱棣是造反稱帝的，對大臣有所猜忌，故恢復了洪武年間廢除的錦衣衛，重新開始實施明朝的特務統治；指揮使紀綱成為永樂朝一大權奸。隨後，永樂十八年，朱棣又設立了東廠，令親信太監掌權，加強特務統治的同時提高了宦官的地位。有明一代，特務統治幾乎貫穿始終，成為一大特點。

由於靖難之役時，朱棣得到了很多來自宦官的幫助，故其即位後改變了太祖禁止宦官干政的政策，開始重用宦官^[224]。一方面，明朝出現了鄭和等著名的優秀宦官，下西洋開展國際交流；另一方面，由於司禮監、東廠等宦官掌權的部門地位提高，且地方鎮守、監督採辦等重要工作皆由宦官擔任（不全為朱棣設置），埋下了日後宦官禍國的種子。

靖難之役涉及整個華北和華東地區，反復的拉鋸戰使得淮河以北的經濟遭到破壞^[225]。朱棣登基後，減免了河北、河南、山東等曾為戰場的省份及其它省份的賦稅，以休養生息^[226]。

明成祖除了誅殺誓死效忠建文帝的大臣外，還下令對殉難諸臣以及一切與建文帝有關的文字著作一概交出燒毀，私自收藏者殺，被燒毀的著作包括如方孝孺所著的《周禮考次》、《大易枝辭》、《帝王基命錄》、《文統》等。^[227]

明太祖於眾親王位下，分別擬定二十字，作為各支親王子孫命名的字輩詩。燕王朱棣派下字輩則為：“高瞻祁見祐，厚載翊常由。”有人說：“高瞻，仰法天也；厚載，俯察地也，天高地厚，氣象甚大，誠謂天子矣。”朱棣聽完欣喜若狂，那人還說：“己名載在圖讖，必有天下望氣者。”又說：“燕地有天子氣。”此事被認為是朱棣謀劃起兵叛變的前兆^[228]。

• 建文改制 —— 建文年間推行的改革，靖難之役後被悉數廢除
• 《洪武三十二》 —— 香港無綫電視一齣以靖難之役為歷史背景的電視劇

• 靖難之役中幾個細節表明：建文帝鬥不過朱棣 （页面存档备份，存于互联网档案馆），dailybuzz.cc
• 央視-明朝多管火箭之謎 （页面存档备份，存于互联网档案馆）