芽孢桿菌屬

本属包括以下物种：^[3]

• Bacillus abyssalis You et al., 2013，异名
• 老鼠簕芽胞杆菌 Bacillus acanthi Ma et al., 2018，异名
• Bacillus acidiceler Peak et al., 2007，异名
• Bacillus acidicola Albert et al., 2005
• Bacillus acidinfaciens Sun et al., 2019，异名
• Bacillus acidiproducens Jung et al., 2009，异名
• Bacillus aciditolerans Ding et al., 2019，异名
• Bacillus acidocaldarius Darland and Brock 1971，异名
• Bacillus acidoterrestris Deinhard et al., 1988，异名
• Bacillus agaradhaerens Nielsen et al., 1995，异名
• Bacillus agri (ex Laubach and Rice 1916) Nakamura 1993，异名
• Bacillus aidingensis Xue et al., 2008，异名
• Bacillus akibai Nogi et al., 2005，异名
• 白色芽胞杆菌 Bacillus albus Liu et al., 2017
• Bacillus alcalophilus Vedder 1934，异名
• Bacillus algicola Ivanova et al., 2004，异名
• Bacillus alginolyticus Nakamura 1987，异名
• Bacillus alkalicellulosilyticus Liu et al. 2022
• Bacillus alkalicola Zhai et al. 2022
• Bacillus alkalidiazotrophicus Sorokin et al., 2008，异名
• Bacillus alkalilacus Singh et al., 2018，异名
• Bacillus alkalinitrilicus Sorokin et al., 2009，异名
• Bacillus alkalisediminis Borsodi et al., 2011，异名
• Bacillus alkalitelluris Lee et al., 2008，异名
• Bacillus alkalitolerans Liu et al., 2018，异名
• Bacillus altitudinis Shivaji et al., 2006
• Bacillus alveayuensis Bae et al., 2005
• Bacillus alvei Cheshire and Cheyne 1885，异名
• 解淀粉芽孢杆菌 Bacillus amyloliquefaciens (ex Fukumoto 1943) Priest et al., 1987
• Bacillus amylolyticus (ex Choukévitch 1911) Nakamura 1984，异名
• Bacillus andreesenii Kosowski et al., 2014，异名
• Bacillus aneurinilyticus corrig. (ex Kimura and Aoyama 1952) Shida et al., 1994，异名
• Bacillus aneurinolyticus (ex Kimura and Aoyama 1952) Shida et al., 1994，拼写错误
• 炭疽芽孢杆菌 Bacillus anthracis Cohn, 1872，也称炭疽桿菌
• Bacillus antri Rao et al., 2019，异名
• Bacillus aquiflavi Xie et al., 2020^[4]
• 海水芽孢杆菌 Bacillus aquimaris Yoon et al., 2003，异名
• Bacillus arachidis Chen et al., 2023^[5]
• Bacillus arenosi Heyrman et al., 2005，异名
• Bacillus arseniciselenatis Switzer Blum et al., 2001，也拼作Bacillus arsenicoselenatis
• Bacillus arsenicus Shivaji et al., 2005，异名
• Bacillus arvi Heyrman et al., 2005，异名
• 阿耶波多氏芽胞杆菌 Bacillus aryabhattai Shivaji et al., 2009，异名
• 朝日芽胞杆菌 Bacillus asahii Yumoto et al., 2004，异名
• 萎缩芽孢杆菌 Bacillus atrophaeus Nakamura 1989
• Bacillus aurantiacus Borsodi et al., 2008，异名
• Bacillus australimaris Liu et al., 2016
• Bacillus axarquiensis Ruiz-García et al., 2005，异名
• Bacillus azotofixans Seldin et al., 1984，异名
• Bacillus azotoformans (ex Pichinoty et al., 1976) Pichinoty et al., 1983，异名
• Bacillus badius Batchelor 1919
• Bacillus barbaricus Täubel et al., 2003，异名
• 巴塞尔芽孢杆菌 Bacillus basilensis Muigg et al. 2024^[6]
• 巴达维亚芽孢杆菌 Bacillus bataviensis Heyrman et al., 2004，为Neobacillus bataviensis (Heyrman et al. 2004) Patel and Gupta 2020异名
• 北京芽孢桿菌 Bacillus beijingensis Qiu et al., 2009，为Bhargavaea beijingensis (Qiu et al. 2009) Verma et al. 2012的异名
• Bacillus benzoevorans Pichinoty et al., 1987
• 白令海芽孢杆菌 Bacillus beringensis Yu et al., 2012^[7]
• Bacillus berkeleyi Nedashkovskaya et al., 2012，异名
• Bacillus beveridgei Baesman et al., 2010，异名
• 兵马俑芽孢杆菌 Bacillus bingmayongensis Liu et al. 2014^[8]
• Bacillus bogoriensis Vargas et al., 2005，为Alkalihalobacterium bogoriense (Vargas et al. 2005) Joshi et al. 2022的异名
• Bacillus boroniphilus Ahmed et al., 2007，为Mesobacillus boroniphilus (Ahmed et al. 2007) Patel and Gupta 2020的异名
• Bacillus borstelensis (ex Porter 1940) Shida et al., 1995，为Brevibacillus borstelensis (Shida et al. 1995 ex Porter 1940) Shida et al. 1996的异名
• Bacillus brevis Migula 1900，为Brevibacillus brevis (Migula 1900) Shida et al. 1996的异名
• Bacillus butanolivorans Kuisiene et al., 2008，异名
• Bacillus cabrialesii de Los Santos Villalobos et al., 2019
• Bacillus caeni Mo et al., 2020，为Pseudalkalibacillus caeni (Mo et al. 2020) Joshi et al. 2022的异名
• Bacillus camelliae Niu et al., 2018，异名
• Bacillus campisalis Kumar et al., 2015，异名
• Bacillus canaveralius Newcombe et al., 2009
• Bacillus capparidis Wang et al., 2017
• Bacillus carboniphilus Fujita et al., 1996
• Bacillus caseinilyticus Vishnuvardhan Reddy et al., 2015，异名
• Bacillus catenulatus Sultanpuram et al., 2018，异名
• Bacillus cavernae Feng et al., 2016，异名
• Bacillus cecembensis Reddy et al., 2008，异名
• Bacillus cellulosilyticus Nogi et al., 2005，异名
• Bacillus centrosporus (ex Ford 1916) Nakamura 1993，异名
• 蠟樣芽孢桿菌 Bacillus cereus Frankland and Frankland 1887
• Bacillus chagannorensis Carrasco et al., 2007，异名
• Bacillus chitinolyticus Kuroshima et al., 1996，异名
• Bacillus chondroitinus Nakamura 1987，异名
• Bacillus choshinensis Takagi et al., 1993，异名
• 韩中芽孢杆菌 Bacillus chungangensis Cho et al., 2010
• Bacillus cibi Yoon et al., 2005，异名
• Bacillus ciccensis Liu et al., 2017，异名
• 环状芽胞杆菌 Bacillus circulans Jordan 1890，异名
• Bacillus clarkii Nielsen et al., 1995，异名
• Bacillus clausii Nielsen et al., 1995，异名
• 芽孢乳酸菌 Bacillus coagulans Hammer 1915，异名
• Bacillus coahuilensis Cerritos et al., 2008
• 科氏芽胞杆菌 Bacillus cohnii Spanka and Fritze 1993，异名^[9]
• Bacillus composti Yang et al., 2013，为Siminovitchia composti (Yang et al. 2013) Gupta et al. 2020的异名
• Bacillus crassostreae Chen et al., 2015，为Metabacillus crassostreae (Chen et al. 2015) Patel and Gupta 2020的异名
• Bacillus crescens Shivani et al., 2015，为Robertmurraya crescens (Shivani et al. 2015) Gupta et al. 2020的异名
• Bacillus cucumis Kämpfer et al., 2016，异名
• Bacillus curdlanolyticus Kanzawa et al., 1995，异名
• Bacillus cycloheptanicus Deinhard et al., 1988，异名
• Bacillus cytotoxicus Guinebretière et al., 2013
• Bacillus dafuensis Zheng et al., 2023^[10]
• 达里湖芽孢杆菌 Bacillus daliensis Zhai et al., 2012，为Alkalicoccus daliensis(Zhai et al. 2012) Gupta et al. 2020的异名
• 大庆芽孢杆菌 Bacillus daqingensis Wang et al. 2023^[11]
• Bacillus decisifrondis Zhang et al., 2007
• Bacillus decolorationis Heyrman et al., 2003，为Pseudalkalibacillus decolorationis (Heyrman et al. 2003) Joshi et al. 2022的异名
• Bacillus depressus Wei et al., 2016，为Cytobacillus depressus (Wei et al. 2016) Patel and Gupta 2020的异名
• Bacillus deserti Zhang et al., 2012，异名
• Bacillus dielmoensis Lo et al. 2021，拼写错误
• Bacillus dielmonensis corrig. Lo et al. 2021，异名
• Bacillus dipsosauri Lawson et al., 1996，异名
• Bacillus drentensis Heyrman et al., 2004，异名
• Bacillus ectoiniformans Zhu et al., 2016
• Bacillus edaphicus Shelobolina et al., 1998，异名
• Bacillus ehimensis Kuroshima et al., 1996，异名
• Bacillus eiseniae Hong et al., 2012，异名
• Bacillus encimensis Dastager et al., 2015，异名
• Bacillus enclensis Dastager et al., 2014
• Bacillus endolithicus Parag et al., 2015，异名
• Bacillus endophyticus Reva et al., 2002，异名
• Bacillus endoradicis Zhang et al., 2012，异名
• Bacillus endozanthoxylicus Ma et al., 2017，异名
• Bacillus farraginis Scheldeman et al., 2004，异名
• Bacillus fastidiosus den Dooren de Jong 1929，异名
• Bacillus fengqiuensis Zhao et al., 2014
• Bacillus fermenti Hirota et al., 2018，异名
• Bacillus filamentosus Sonalkar et al., 2015，异名
• Bacillus firmus Bredemann and Werner 1933，异名
• Bacillus flexus (ex Batchelor 1919) Priest et al., 1989，异名
• Bacillus foraminis Tiago et al., 2006，异名
• Bacillus fordii Scheldeman et al., 2004，异名
• 台湾芽胞杆菌 Bacillus formosensis Lin et al., 2015，异名
• Bacillus formosus (ex Porter 1940) Shida et al., 1995，异名
• Bacillus fortis Scheldeman et al., 2004，异名
• Bacillus fumarioli Logan et al., 2000，异名
• 蘑菇芽胞杆菌 Bacillus fungorum Liu et al., 2020
• Bacillus funiculus Ajithkumar et al., 2002，异名
• Bacillus fusiformis (ex Meyer and Gottheil 1901) Priest et al., 1989，异名
• Bacillus gaemokensis Jung et al. 2021
• Bacillus galactophilus Takagi et al., 1993，为Brevibacillus agri (Nakamura 1993 ex Laubach and Rice 1916) Shida et al. 1996的异名
• Bacillus galactosidilyticus Heyndrickx et al., 2004，异名
• Bacillus galliciensis Balcázar et al., 2010，为Metabacillus galliciensis (Balcázar et al. 2010) Patel and Gupta 2020的异名
• Bacillus gelatini De Clerck et al., 2004，为Fictibacillus gelatini (De Clerck et al. 2004) Glaeser et al. 2013的异名
• Bacillus gibsonii Nielsen et al., 1995，异名
• Bacillus ginsengi Qiu et al., 2009，异名
• 人参芽孢杆菌 Bacillus ginsengihumi Ten et al., 2007，异名
• 人参土芽孢杆菌 Bacillus ginsengisoli Nguyen et al., 2013，异名
• Bacillus glennii Seuylemezian et al., 2020，异名
• Bacillus globisporus Larkin and Stokes 1967，异名
• Bacillus glucanolyticus Alexander and Priest 1989，异名
• Bacillus glycinifermentans Kim et al., 2015
• 戈壁芽孢杆菌 Bacillus gobiensis Liu et al., 2016
• Bacillus gordonae Pichinoty et al., 1987，异名
• Bacillus gossypii Kämpfer et al., 2015，异名
• Bacillus gottheilii Seiler et al., 2013，异名
• Bacillus graminis Bibi et al., 2011，异名
• Bacillus halmapalus Nielsen et al., 1995，异名
• 喜盐噬糖芽胞杆菌 Bacillus haloalkaliphilus Fritze 1996，异名
• Bacillus halochares Pappa et al., 2010，异名
• 嗜盐脱氮芽孢杆菌 Bacillus halodenitrificans Denariaz et al., 1989，异名
• Bacillus halodurans (ex Boyer et al., 1973) Nielsen et al., 1995，异名
• Bacillus halophilus Ventosa et al., 1990，异名
• Bacillus halosaccharovorans Mehrshad et al., 2013，异名
• Bacillus halotolerans (Delaporte and Sasson 1967) Tindall 2017
• Bacillus harenae
• Bacillus haynesii Dunlap et al., 2017
• Bacillus hemicellulosilyticus Nogi et al., 2005，异名
• Bacillus hemicentroti Chen et al., 2011，异名
• Bacillus herbersteinensis Wieser et al., 2005，异名
• Bacillus hisashii Nishida et al., 2015，异名
• Bacillus hominis Tohya et al. 2021^[12]
• Bacillus horikoshii Nielsen et al., 1995，异名
• Bacillus horneckiae Vaishampayan et al., 2010，异名
• Bacillus horti Yumoto et al., 1998
• 惠州芽孢桿菌 Bacillus huizhouensis Li et al., 2014，异名
• 土芽胞杆菌 Bacillus humi Heyrman et al., 2005，异名
• Bacillus hwajinpoensis Yoon et al., 2004，异名
• Bacillus idriensis Ko et al., 2006，异名
• Bacillus inaquosorum (Rooney et al., 2009) Dunlap et al., 2020
• 印度芽孢杆菌 Bacillus indicus Suresh et al., 2004，异名
• Bacillus infantis Ko et al., 2006
• Bacillus infernus Boone et al., 1995
• Bacillus insolitus Larkin and Stokes 1967，异名
• Bacillus invictae Branquinho et al., 2014，异名
• Bacillus iocasae Wang et al., 2017，异名
• 伊朗芽孢桿菌 Bacillus iranensis Bagheri et al., 2012，异名
• Bacillus isabeliae Albuquerque et al., 2008
• Bacillus isronensis Shivaji et al., 2009，异名
• Bacillus jeddahensis Bittar et al., 2017，异名^[13]
• Bacillus jeotgali Yoon et al., 2001，异名
• Bacillus kaustophilus (ex Prickett 1928) Priest et al., 1989，异名
• Bacillus kexueae Sun et al., 2018
• Bacillus kiskunsagensis Borsodi et al., 2017，异名^[14]
• Bacillus kobensis Kanzawa et al., 1995，异名
• 科赫芽孢杆菌 Bacillus kochii Seiler et al., 2012，异名
• 小木偶形芽孢杆菌 Bacillus kokeshiiformis Poudel et al., 2014，异名
• 朝鲜芽孢桿菌 Bacillus koreensis Lim et al., 2006，韩国芽孢杆
• 库尔勒芽孢杆菌 Bacillus korlensis Zhang et al., 2009，异名
• 胶冻样芽孢杆菌 Bacillus kribbensis Lim et al., 2007，异名
• 克鲁氏芽孢杆菌 Bacillus krulwichiae Yumoto et al., 2003，异名
• Bacillus lacisalsi Dong et al. 2021，异名
• Bacillus lacus Singh et al., 2018，异名
• Bacillus laevolacticus (ex Nakayama and Yanoshi 1967) Andersch et al., 1994，异名
• Bacillus larvae White 1906，异名
• Bacillus laterosporus Laubach 1916，异名
• Bacillus lautus (ex Batchelor 1919) Nakamura 1984，异名
• Bacillus lehensis Ghosh et al., 2007，异名
• Bacillus lentimorbus Dutky 1940，异名
• Bacillus lentus Gibson 1935，异名
• 地衣芽孢杆菌 Bacillus licheniformis (Weigmann 1898) Chester 1901
• Bacillus ligniniphilus Zhu et al., 2014，异名
• Bacillus lindianensis Dou et al., 2016，异名
• Bacillus litoralis Yoon and Oh 2005，异名
• 海淀沉积物芽孢杆菌 Bacillus litorisediminis Tang et al. 2023^[15]
• Bacillus locisalis Márquez et al., 2011，为Salisediminibacterium locisalis (Márquez et al. 2011) Sultanpuram et al. 2015的异名
• Bacillus loiseleuriae Liu et al., 2016，为Peribacillus loiseleuriae (Liu et al. 2016) Patel and Gupta 2020的异名
• Bacillus lonarensis Reddy et al., 2015，为Shouchella lonarensis (Reddy et al. 2015) Joshi et al. 2022的异名
• Bacillus luciferensis Logan et al., 2002，为Gottfriedia luciferensis (Logan et al. 2002) Gupta et al. 2020的异名
• Bacillus luteolus Shi et al., 2011，为Cytobacillus luteolus (Shi et al. 2011) Gupta et al. 2020的异名
• Bacillus luteus Subhash et al., 2014，为Alkalicoccus luteus (Subhash et al. 2014) Gupta et al. 2020的异名
• 泥芽胞杆菌 Bacillus luti Liu et al., 2017
• Bacillus lycopersici Lin et al., 2015，为Caldibacillus lycopersici (Lin et al. 2015) Gupta et al. 2020的异名
• 澳门芽孢桿菌 Bacillus macauensis Zhang et al., 2006，异名
• Bacillus macerans Schardinger 1905，异名
• Bacillus macquariensis Marshall and Ohye 1966，异名
• Bacillus macyae Santini et al., 2004，异名
• Bacillus malacitensis Ruiz-García et al., 2005，异名
• Bacillus malikii Abbas et al., 2016，异名
• Bacillus mangrovi Gupta et al., 2017，异名
• Bacillus manliponensis Jung et al. 2021
• Bacillus mannanilyticus Nogi et al., 2005，为Caldalkalibacillus mannanilyticus (Nogi et al. 2005) Gupta et al. 2020的异名
• Bacillus manusensis Sun et al., 2018
• Bacillus marinisedimentorum Guo et al., 2018
• Bacillus marinus (Rüger and Richter 1979) Rüger 1983，为Jeotgalibacillus marinus (Rüger and Richter 1979) Yoon et al. 2010的异名
• Bacillus marisflavi Yoon et al., 2003，为Rossellomorea marisflavi (Yoon et al. 2003) Gupta et al. 2020的异名
• 海洋芽孢杆菌 Bacillus marismortui Arahal et al., 1999，异名
• Bacillus maritimus Pal et al., 2017，为Mesobacillus maritimus (Pal et al. 2017) Patel and Gupta 2020的异名
• Bacillus marmarensis Denizci et al., 2010，为Alkalihalophilus marmarensis (Denizci et al. 2010) Joshi et al. 2022的异名
• 摩洛哥芽孢杆菌 Bacillus maroccanus Delaporte and Sasson 1967
• 马赛芽孢杆菌 Bacillus massiliensis Glazunova et al., 2006，为Ureibacillus massiliensis (Glazunova et al. 2006) Gupta and Patel 2020的异名
• Bacillus massiliigabonensis corrig. Sarr et al. 2021，也拼作：Bacillus massiliogabonensis
• Bacillus massiliigorillae corrig. Keita et al. 2023^[16]，也拼作：Bacillus massiliogorillae
• Bacillus massiliosenegalensis Ramasamy et al., 2016，异名
• 巨大芽孢杆菌 Bacillus megaterium de Bary 1884，为Priestia megaterium (de Bary 1884) Gupta et al. 2020的异名
• Bacillus mesonae Liu et al., 2014，为Neobacillus mesonae (Liu et al. 2014) Patel and Gupta 2020的异名
• Bacillus mesophilus Zhou et al., 2017
• Bacillus methanolicus Arfman et al., 1992
• Bacillus methylotrophicus Madhaiyan et al., 2010，为Bacillus velezensis Ruiz-García et al. 2005的异名
• Bacillus migulanus Takagi et al., 1993，为Aneurinibacillus migulanus (Takagi et al. 1993) Shida et al. 1996的异名
• Bacillus miscanthi Shin et al., 2020，为Shouchella miscanthi (Shin et al. 2020) Joshi et al. 2022的异名
• 运动芽胞杆菌 Bacillus mobilis Liu et al., 2017
• 莫哈韦芽孢杆菌 Bacillus mojavensis Roberts et al., 1994
• Bacillus mucilaginosus Avakyan et al., 1998，异名
• Bacillus muralis Heyrman et al., 2005，异名
• Bacillus murimartini Borchert et al., 2007，异名
• 蕈状芽孢杆菌 Bacillus mycoides Flügge 1886
• Bacillus naganoensis Tomimura et al., 1990，异名
• Bacillus nakamurai Dunlap et al., 2016
• 南海芽孢桿菌 Bacillus nanhaiensis Chen et al., 2011，异名
• Bacillus nanhaiisediminis Zhang et al., 2011，异名^[17]
• Bacillus natronophilus Menes et al., 2020，异名
• Bacillus ndiopicus Lo et al., 2017
• Bacillus nealsonii Venkateswaran et al., 2003，异名
• Bacillus neidei Nakamura et al., 2002，异名
• Bacillus neizhouensis Chen et al., 2009，异名
• Bacillus niabensis Kwon et al., 2007，异名
• Bacillus niacini Nagel and Andreesen 1991，异名
• 硝酸盐还原芽胞杆菌 Bacillus nitratireducens Liu et al., 2017
• Bacillus notoginsengisoli Zhang et al., 2017，异名
• Bacillus novalis Heyrman et al., 2004，异名
• Bacillus oceani Song et al., 2016，异名
• Bacillus oceanisediminis Zhang et al., 2010，异名^[18]
• Bacillus odysseyi La Duc et al., 2004，异名
• Bacillus okhensis Nowlan et al., 2006，异名
• Bacillus okuhidensis Li et al., 2002，异名
• Bacillus oleivorans Azmatunnisa et al., 2015
• Bacillus oleronius Kuhnigk et al., 1996，异名
• Bacillus onubensis Dominguez-Moñino et al., 2018，异名
• Bacillus oryzaecorticis Hong et al., 2014，异名
• Bacillus oryzisoli Zhang et al., 2016，异名
• Bacillus oryziterrae Bao et al., 2017，异名
• Bacillus oshimensis Yumoto et al., 2005，异名
• Bacillus pabuli (ex Schieblich 1923) Nakamura 1984，异名
• 太平洋芽胞杆菌 Bacillus pacificus Liu et al., 2017
• 巴基斯坦芽孢桿菌 Bacillus pakistanensis Roohi et al., 2014
• Bacillus pallidus Zhou et al., 2008，异名
• Bacillus pallidus Scholz et al., 1988，异名
• Bacillus panacisoli Choi and Cha 2014，异名
• Bacillus panaciterrae Ten et al., 2006，异名
• Bacillus pantothenticus Proom and Knight 1950，异名
• Bacillus parabrevis Takagi et al., 1993，异名
• Bacillus paraflexus Chandna et al., 2013，异名
• 副地衣芽孢杆菌 Bacillus paralicheniformis Dunlap et al., 2015
• Bacillus paramobilis Tohya et al. 2021^[19]
• 副蕈状芽胞杆菌 Bacillus paramycoides Liu et al., 2017
• 副炭疽芽胞杆菌 Bacillus paranthracis Liu et al., 2017
• Bacillus pasinlerensis Baltaci et al., 2020，异名
• Bacillus pasteurii (Miquel 1889) Chester 1898，异名
• 巴塔哥尼亚芽孢杆菌 Bacillus patagoniensis Olivera et al., 2005，为Shouchella patagoniensis (Olivera et al. 2005) Joshi et al. 2022的异名
• Bacillus peoriae Montefusco et al., 1993，异名
• Bacillus persepolensis Amoozegar et al., 2009，异名
• Bacillus persicus Didari et al., 2013，为Mesobacillus persicus (Didari et al. 2013) Patel and Gupta 2020的异名
• Bacillus pervagus Kosowski et al., 2014
• 耐压芽胞杆菌 Bacillus piezotolerans Yu et al., 2019，为Neobacillus piezotolerans (Yu et al. 2019) Gupta et al. 2020的异名
• Bacillus pinisoli Huang et al. 2023^[20]
• Bacillus piscicola Daroonpunt et al., 2016
• Bacillus plakortidis Borchert et al., 2007，异名
• Bacillus pocheonensis Ten et al., 2007，异名
• Bacillus polygoni Aino et al., 2008，异名
• Bacillus polymachus Nguyen and Kim 2015，异名
• Bacillus polymyxa (Prazmowski 1880) Macé 1889，异名
• Bacillus popilliae Dutky 1940，异名
• Bacillus populi Liu et al., 2018，异名
• Bacillus praedii Liu et al., 2017，异名
• 解蛋白芽胞杆菌 Bacillus proteolyticus Liu et al., 2017
• Bacillus pseudalcaliphilus corrig. Nielsen et al., 1995，异名
• Bacillus pseudalcalophilus Nielsen et al., 1995，拼写错误
• Bacillus pseudofirmus Nielsen et al., 1995，异名
• Bacillus pseudomycoides Nakamura 1998
• Bacillus psychrodurans Abd El-Rahman et al., 2002，异名
• Bacillus psychrophilus (ex Larkin and Stokes 1967) Nakamura 1984，异名
• Bacillus psychrosaccharolyticus (ex Larkin and Stokes 1967) Priest et al., 1989，异名
• Bacillus psychrotolerans Abd El-Rahman et al., 2002，为'Psychrobacillus psychrotolerans (Abd El-Rahman et al. 2002) Krishnamurthi et al. 2011的异名
• Bacillus pulvifaciens (ex Katznelson 1950) Nakamura 1984，异名
• 短小芽孢杆菌 Bacillus pumilus Meyer and Gottheil， 1901
• Bacillus purgationiresistans Vaz-Moreira et al., 2012，拼写错误
• 抗净化芽胞杆菌 Bacillus purgationiresistens Vaz-Moreira et al., 2012，异名
• Bacillus pycnus Nakamura et al., 2002，为Rummeliibacillus pycnus (Nakamura et al. 2002) Vaishampayan et al. 2009的异名
• 青岛芽胞杆菌 Bacillus qingdaonensis Wang et al., 2007，异名
• 庆笙芽胞杆菌 Bacillus qingshengii Xi et al., 2014，异名
• Bacillus reuszeri Shida et al., 1995，为Brevibacillus reuszeri (Shida et al. 1995) Shida et al. 1996的异名
• Bacillus rhizoplanae Kämpfer et al. 2022
• Bacillus rhizosphaerae Madhaiyan et al., 2013，为庆笙普里斯特氏菌 （Priestia qingshengii (Xi et al. 2014) Gupta et al. 2020）的异名
• Bacillus rigiliprofundi Sylvan et al., 2015，异名
• Bacillus rigui Baik et al., 2010，异名
• Bacillus ruris Heyndrickx et al., 2005，异名
• Bacillus safensis Satomi et al., 2006
• Bacillus saganii Seuylemezian et al., 2020，异名
• Bacillus salacetis Daroonpunt et al., 2019
• Bacillus salarius Lim et al., 2006，为Salibacterium salarium (Lim et al. 2006) Gupta et al. 2020的异名
• Bacillus salexigens Garabito et al., 1997，为Virgibacillus salexigens (Garabito et al. 1997) Heyrman et al. 2003的异名
• Bacillus salidurans Son et al., 2019，为Ferdinandcohnia salidurans (Son et al. 2019) Gupta et al. 2020的异名
• Bacillus salinus Kang et al., 2020
• Bacillus saliphilus Romano et al., 2005，为Alkalicoccus saliphilus (Romano et al. 2005) Zhao et al. 2017的异名
• Bacillus salis Seck et al. 2023^[21]
• Bacillus salitolerans Zhang et al., 2015
• Bacillus salsus Amoozegar et al., 2013，为Litchfieldia salsa (Amoozegar et al. 2013) Gupta et al. 2020的异名
• Bacillus sanguinis Tohya et al. 2021^[22]
• Bacillus schlegelii Schenk and Aragno 1981，异名
• 沉积物芽孢杆菌 Bacillus sediminis Yu et al., 2014，异名
• Bacillus selenatarsenatis Yamamura et al., 2007，异名
• Bacillus selenitireducens Switzer Blum et al., 2001，异名
• Bacillus seohaeanensis Lee et al., 2006
• Bacillus shacheensis Lei et al., 2014，异名
• Bacillus shackletonii Logan et al., 2004，异名
• Bacillus shivajii Kumar et al., 2018
• 暹罗芽孢桿菌 Bacillus siamensis Sumpavapol et al., 2010
• Bacillus silvestris Rheims et al., 1999，异名
• Bacillus simplex (ex Meyer and Gottheil 1901) Priest et al., 1989，异名
• Bacillus sinesaloumensis Sarr et al. 2021
• Bacillus siralis Pettersson et al., 2000，异名
• Bacillus smithii Nakamura et al., 1988
• Bacillus solani Liu et al., 2015，异名
• 土壤芽孢杆菌 Bacillus soli Heyrman et al., 2004，异名
• Bacillus solimangrovi Lee et al., 2014
• Bacillus solisalsi Liu et al., 2009，异名^[23]
• Bacillus solisilvae Pan et al., 2017，异名
• Bacillus songklensis Kang et al., 2013
• Bacillus sonorensis Palmisano et al., 2001
• 球形芽孢杆菌 Bacillus sphaericus Meyer and Neide 1904，异名
• Bacillus spizizenii (Nakamura et al., 1999) Dunlap et al., 2020
• 海绵芽孢杆菌 Bacillus spongiae Lee et al., 2019
• Bacillus sporothermodurans Pettersson et al., 1996，异名
• Bacillus stamsii Müller et al., 2016，异名
• 嗜热脂肪芽孢杆菌 Bacillus stearothermophilus Donk 1920，异名
• Bacillus stercoris (Adelskov and Patel 2017) Dunlap et al., 2020
• Bacillus suaedae Lei et al. 2022
• Bacillus suaedae Xu et al. 2022，异名
• Bacillus suaedaesalsae Xu et al. 2022
• Bacillus subterraneus Kanso et al., 2002，异名
• 枯草芽孢桿菌 Bacillus subtilis (Ehrenberg 1835) Cohn 1872
• Bacillus swezeyi Dunlap et al., 2017
• Bacillus taeanensis Lim et al., 2006
• 台湾芽孢桿菌 Bacillus taiwanensis Liu et al., 2015，为Priestia taiwanensis (Liu et al. 2015) Gupta et al. 2020的异名
• Bacillus tamaricis Zhang et al., 2018，为Evansella tamaricis (Zhang et al. 2018) Narsing Rao et al. 2022的异名
• Bacillus taxi Tuo et al., 2020，为Niallia taxi (Tuo et al. 2020) Gupta et al. 2020的异名
• Bacillus tepidiphilus Narsing Rao et al. 2021，为Peribacillus tepidiphilus (Narsing Rao et al. 2021) Narsing Rao et al. 2023的异名
• 特基拉芽孢杆菌 Bacillus tequilensis Gatson et al., 2006
• Bacillus terrae Díez-Méndez et al., 2017，为Siminovitchia terrae (Díez-Méndez et al. 2017) Gupta et al. 2020的异名
• Bacillus thermantarcticus Nicolaus et al., 2002，异名
• Bacillus thermoaerophilus Meier-Stauffer et al., 1996，异名
• Bacillus thermoamylovorans Combet-Blanc et al., 1995
• Bacillus thermoantarcticus Nicolaus et al., 2002，拼写错误
• Bacillus thermocatenulatus Golovacheva et al., 1991，异名
• Bacillus thermocloacae Demharter and Hensel 1989
• Bacillus thermocloaceae Demharter and Hensel 1989，拼写错误
• Bacillus thermocopriae Han et al., 2013，异名
• Bacillus thermodenitrificans (ex Klaushofer and Hollaus 1970) Manachini et al., 2000，异名
• Bacillus thermoglucosidasius Suzuki 1984，异名
• Bacillus thermolactis Coorevits et al., 2011，异名
• Bacillus thermoleovorans Zarilla and Perry 1988，异名
• Bacillus thermophilus Yang et al., 2013，异名
• Bacillus thermoruber (ex Guicciardi et al., 1968) Manachini et al., 1985，异名
• Bacillus thermosphaericus Andersson et al., 1996，异名
• Bacillus thermotolerans Yang et al., 2013
• Bacillus thiaminolyticus (ex Kuno 1951) Nakamura 1990，异名
• Bacillus thioparans corrig. Pérez-Ibarra et al., 2007，异名
• Bacillus thioparus Pérez-Ibarra et al., 2007，拼写错误
• 苏云金芽孢杆菌 Bacillus thuringiensis Berliner 1915
• Bacillus tianshenii Jiang et al., 2014
• Bacillus toyonensis Jiménez et al., 2014
• 热带芽胞杆菌 Bacillus tropicus Liu et al., 2017
• Bacillus trypoxylicola Aizawa et al., 2010，异名
• Bacillus tusciae Bonjour and Aragno 1985，异名
• Bacillus urbisdiaboli Liu et al., 2019，异名
• 乌鲁木齐芽孢杆菌 Bacillus urumqiensis Zhang et al., 2016
• Bacillus validus (ex Bredemann and Heigener 1935) Nakamura 1984，异名
• Bacillus vallismortis Roberts et al., 1996
• Bacillus vedderi Agnew et al., 1996，异名
• Bacillus velezensis Ruiz-García et al., 2005
• 越南芽孢桿菌 Bacillus vietnamensis Noguchi et al., 2004，异名
• Bacillus vini Ma et al., 2017，异名
• Bacillus vireti Heyrman et al., 2004，异名
• Bacillus vulcani Caccamo et al., 2000，异名
• Bacillus wakoensis Nogi et al., 2005，异名
• 魏登施泰芽孢杆菌 Bacillus weihenstephanensis Lechner et al., 1998，异名
• Bacillus wiedmannii Miller et al., 2016
• 五大连池芽孢桿菌 Bacillus wudalianchiensis Liu et al., 2017
• 武夷山芽孢桿菌 Bacillus wuyishanensis Liu et al., 2015，异名
• 厦门芽孢桿菌 Bacillus xiamenensis Lai et al., 2014
• Bacillus xiaoxiensis Chen et al., 2011，异名
• 霞浦海沟芽胞杆菌 Bacillus xiapuensis Liu et al., 2019
• 雅浦海沟芽胞杆菌 Bacillus yapensis Xu et al. 2020^[24]
• Bacillus zeae Kämpfer et al., 2017，异名
• 漳州芽孢桿菌 Bacillus zhangzhouensis Liu et al., 2016
• 湛江芽孢桿菌 Bacillus zhanjiangensis Chen et al., 2012，异名

维基共享资源上的相关多媒体资源：芽孢桿菌屬

• Bacillus genomes and related information at PATRIC, a Bioinformatics Resource Center funded by NIAID （页面存档备份，存于互联网档案馆）