EFCAB6

EFCAB6
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1WLZ, 5D67
Ідентифікатори
Символи	EFCAB6, DJBP, HSCBCIP1, dJ185D5.1, EF-hand calcium binding domain 6
Зовнішні ІД	MGI: 1924877 HomoloGene: 11259 GeneCards: EFCAB6
Онтологія гена
Молекулярна функція	• зв'язування з іоном металу; • calcium ion binding;
Клітинна компонента	• клітинне ядро; • нуклеоплазма;
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • transcription, DNA-templated;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	64800
	77627
	ENSG00000186976
	ENSMUSG00000022441
	Q5THR3
	Q6P1E8
	NM_022785; NM_198856
	NM_001161628; NM_001161629; NM_029946
	NP_073622; NP_942153
	NP_001155100; NP_001155101; NP_084222
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

EFCAB6 (англ. EF-hand calcium binding domain 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 501 амінокислот, а молекулярна маса — 172 930^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MCKMAIIPDW	LRSHPHTRKF	THSRPHSSPC	RVYSRNGSPN	KFRSSSTTAV
ANPTLSSLDV	KRILFQKITD	RGDELQKAFQ	LLDTGQNLTV	SKSELRRIIT
DFLMPLTREQ	FQDVLAQIPL	STSGTVPYLA	FLSRFGGIDL	YINGIKRGGG
NEMNCCRTLR	ELEIQVGEKV	FKNIKTVMKA	FELIDVNKTG	LVRPQELRRV
LETFCMKLRD	EEYEKFSKHY	NIHKDTAVDY	NVFLKNLSIN	NDLNLRYCMG
NQEVSLENQQ	AKNSKKERLL	GSASSEDIWR	NYSLDEIERN	FCLQLSKSYE
KVEKALSAGD	PCKGGYVSFN	YLKIVLDTFV	YQIPRRIFIQ	LMKRFGLKAT
TKINWKQFLT	SFHEPQGLQV	SSKGPLTKRN	SINSRNESHK	ENIITKLFRH
TEDHSASLKK	ALLIINTKPD	GPITREEFRY	ILNCMAVKLS	DSEFKELMQM
LDPGDTGVVN	TSMFIDLIEE	NCRMRKTSPC	TDAKTPFLLA	WDSVEEIVHD
TITRNLQAFY	NMLRSYDLGD	TGRIGRNNFK	KIMHVFCPFL	TNAHFIKLCS
KIQDIGSGRI	LYKKLLACIG	IDGPPTVSPV	LVPKDQLLSE	HLQKDEQQQP
DLSERTKLTE	DKTTLTKKMT	TEEVIEKFKK	CIQQQDPAFK	KRFLDFSKEP
NGKINVHDFK	KVLEDTGMPM	DDDQYALLTT	KIGFEKEGMS	YLDFAAGFED
PPMRGPETTP	PQPPTPSKSY	VNSHFITAEE	CLKLFPRRLK	ESFRDPYSAF
FKTDADRDGI	INMHDLHRLL	LHLLLNLKDD	EFERFLGLLG	LRLSVTLNFR
EFQNLCEKRP	WRTDEAPQRL	IRPKQKVADS	ELACEQAHQY	LVTKAKNRWS
DLSKNFLETD	NEGNGILRRR	DIKNALYGFD	IPLTPREFEK	LWARYDTEGK
GHITYQEFLQ	KLGINYSPAV	HRPCAEDYFN	FMGHFTKPQQ	LQEEMKELQQ
STEKAVAARD	KLMDRHQDIS	KAFTKTDQSK	TNYISICKMQ	EVLEECGCSL
TEGELTHLLN	SWGVSRHDNA	INYLDFLRAV	ENSKSTGAQP	KEKEESMPIN
FATLNPQEAV	RKIQEVVESS	QLALSTAFSA	LDKEDTGFVK	ATEFGQVLKD
FCYKLTDNQY	HYFLRKLRIH	LTPYINWKYF	LQNFSCFLEE	TADEWAEKMP
KGPPPTSPKA	TADRDILARL	HKAVTSHYHA	ITQEFENFDT	MKTNTISREE
FRAICNRRVQ	ILTDEQFDRL	WNEMPVNAKG	RLKYPDFLSR	FSSETAATPM
ATGDSAVAQR	GSSVPDVSEG	TRSALSLPTQ	ELRPGSKSQS	HPCTPASTTV
IPGTPPLQNC	DPIESRLRKR	IQGCWRQLLK	ECKEKDVARQ	GDINASDFLA
LVEKFNLDIS	KEECQQLIIK	YDLKSNGKFA	YCDFIQSCVL	LLKAKESSLM
HRMKIQNAHK	MKEAGAETPS	FYSALLRIQP	KIVHCWRPMR	RTFKSYDEAG
TGLLSVADFR	TVLRQYSINL	SEEEFFHILE	YYDKTLSSKI	SYNDFLRAFL
Q

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан
Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у ядрі.

Література

Примітки

Див. також

Хромосома 22

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[3]

[4]

[1]

[2]