Liga de Honra de 1999–00
A edição de 1999-2000 da Liga de Honra foi a décima edição deste escalão do futebol português.
Foi disputada por 18 clubes: 3 despromovidos da Primeira Liga, 3 promovidos da II Divisão, e os restantes que tinham permanecido.
O vencedor foi o Paços de Ferreira. Acompanharam na subida à Primeira Divisão o Beira-Mar e o Desportivo das Aves, que ficaram em segundo e terceiro lugares respectivamente.
Moreirense, Esposende e Sporting da Covilhã foram despromovidos para a II Divisão.
Equipas
Equipas a disputar a edição em relação à edição anterior
Tabela classificativa
| Equipa | Pts | J | V | E | D | GM | GS | +/- | Comments | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1. | Paços de Ferreira | 65 | 34 | 19 | 8 | 7 | 56 | 31 | +25 | Promovidos à Primeira Divisão |
| 2. | Beira-Mar | 65 | 34 | 18 | 11 | 5 | 54 | 30 | +24 | |
| 3. | Desportivo das Aves | 61 | 34 | 18 | 7 | 9 | 33 | 24 | +9 | |
| 4. | Varzim | 60 | 34 | 17 | 9 | 8 | 53 | 33 | +20 | |
| 5. | Académica de Coimbra | 57 | 34 | 16 | 9 | 9 | 55 | 37 | +18 | |
| 6. | Penafiel | 56 | 34 | 14 | 14 | 6 | 52 | 33 | +19 | |
| 7. | Felgueiras | 51 | 34 | 14 | 9 | 11 | 42 | 36 | +6 | |
| 8. | U. Lamas | 46 | 34 | 14 | 4 | 16 | 39 | 50 | -11 | |
| 9. | Sp. Espinho | 45 | 34 | 13 | 6 | 15 | 51 | 48 | +3 | |
| 10. | Freamunde | 45 | 34 | 11 | 12 | 11 | 42 | 37 | +5 | |
| 11. | Leça | 45 | 34 | 13 | 6 | 15 | 41 | 49 | -8 | |
| 12. | Chaves | 44 | 34 | 11 | 11 | 12 | 46 | 45 | +1 | |
| 13. | Naval | 42 | 34 | 11 | 9 | 14 | 53 | 55 | -2 | |
| 14. | Maia | 42 | 34 | 11 | 9 | 14 | 35 | 44 | -9 | |
| 15. | Imortal | 33 | 34 | 8 | 9 | 17 | 43 | 64 | -21 | |
| 16. | Moreirense | 29 | 34 | 6 | 11 | 17 | 29 | 49 | -30 | |
| 17. | Esposende | 28 | 34 | 8 | 4 | 22 | 31 | 65 | -34 | |
| 18. | Sp. Covilhã | 25 | 34 | 5 | 10 | 19 | 23 | 48 | -25 |
Nota 1: cada vitória valia 3 pontos
Nota 2: quando dois ou mais clubes têm os mesmos pontos, a classificação é determinada pelos resultados dos jogos entre eles.
Melhor marcador
Marcos Nangi, mais conhecido como Marcão, futebolista brasileiro, foi o melhor marcador, tendo marcado 27 golos ao longo da época, que jogou pelo Varzim.
Treinadores
Alguns dos treinadores das equipas no decorrer da época:
| Equipa | Treinador |
|---|---|
| Académica de Coimbra |  Carlos Garcia |
| Beira-Mar | António Sousa |
| Felgueiras | Diamantino Miranda |
| Imortal | Ricardo Formosinho Paco Fortes |
| Maia | Horácio Gonçalves |
| Paços de Ferreira | José Mota |
| Penafiel | Luís Campos |
| Sp. Espinho | Carlos Carvalhal |
| Varzim | Rogério Gonçalves |
