Voorronde De voorronde werd gespeeld in groepen. De 36 deelnemende teams werden ingedeeld in negen groepen van vier teams. De negen groepswinnaars stroomden door naar de knockoutfase. De loting vond plaats op 24 juni 2016. De wedstrijden werden van 23-28 augustus gespeeld.
Groep 1 De wedstrijden werden gespeeld in het Pafiakostadion te Paphos en het Tsirionstadion te Limasol , Cyprus .
Uitslagen 23 augustus Apollon Limasol 5-0 KÍ Klaksvík Pafiakostadion PAOK Saloniki 1-1 KF Hajvalia 25 augustus KÍ Klaksvík 1-1 PAOK Saloniki Apollon Limasol 1-0 KF Hajvalia 28 augustus KF Hajvalia 1-1 KÍ Klaksvík PAOK Saloniki 3-3 Apollon Limasol Tsirionstadion
Groep 2 De wedstrijden werden gespeeld in het Stadion Gradski vrt te Osijek en in het stadion van HNK Cibalia te Vinkovci , Kroatië .
Uitslagen 23 augustus Standard Luik 1-3 FK Minsk Stadion Gradski vrt ŽNK Osijek 14-1 FK Dragon 2014 25 augustus Standard Luik 11-0 FK Dragon 2014 FK Minsk 5-0 ŽNK Osijek 28 augustus ŽNK Osijek 1-1 Standard Luik FK Dragon 2014 0-9 FK Minsk stadion HNK Cibalia
Groep 3 De wedstrijden werden gespeeld in het Cyncoed Stadium te Cardiff en in het Jenner Park Stadium te Barry , Wales .
Uitslagen 23 augustus NSA Sofia 0-4 Cardiff Met. LFC Cyncoed Stadium Spartak Subotica 1-1 Breiðablik 25 augustus Breiðablik 5-0 NSA Sofia Spartak Subotica 3-2 Cardiff Met. LFC 28 augustus Cardiff Met. LFC 0-8 Breiðablik NSA Sofia 0-2 Spartak Subotica Jenner Park Stadium
Groep 4 De wedstrijden werden gespeeld in het Złotej Jedenastkistadion te Konin en in het Miejskistadion te Września , Polen .
# Club W G V Pnt V-T 1 KKPK Medyk Konin3 0 0 9 13-1 2 CFF Olimpia Cluj2 0 1 6 18-4 3 Pärnu JK 0 1 2 1 0 3-104 ŽFK Breznica0 1 2 1 0 2-21
Uitslagen 23 augustus CFF Olimpia Cluj 7-1 Pärnu JK Złotej Jedenastkistadion KKPK Medyk Konin 9-0 ŽFK Breznica 25 augustus CFF Olimpia Cluj 10-0 ŽFK Breznica Pärnu JK 0-1 KKPK Medyk Konin 28 augustus KKPK Medyk Konin 3-1 CFF Olimpia Cluj ŽFK Breznica 2-2 Pärnu JK Miejskistadion
Groep 5 De wedstrijden werden gespeeld in het Beltinci Sports Park te Beltinci en in het Lendava Sports Park te Lendava , Slovenië .
Uitslagen 23 augustus FC Zürich 3-1 Slovan Bratislava Beltinci Sports Park Pomurje 6-1 Vllaznia Shkodër Lendava Sports Park 25 augustus FC Zürich 3-0 Vllaznia Shkodër Beltinci Sports Park Slovan Bratislava 2-4 Pomurje Lendava Sports Park 28 augustus Pomurje 0-5 FC Zürich Beltinci Sports Park Vllaznia Shkodër 1-2 Slovan Bratislava Lendava Sports Park
Groep 6 De wedstrijden werden gespeeld in het Otokastadion en in het Asim Ferhatović Hasestadion te Sarajevo , Bosnië en Herzegovina .
# Club W G V Pnt V-T 1 SFK 20003 0 0 9 11-1 2 FC Ramat Hasjaron2 0 1 6 10-8 3 Schytlobud-1 Charkov1 0 2 3 0 5-84 Riga FS 0 0 3 0 0 2-11
Uitslagen 23 augustus SFK 2000 1-0 Ramat Hasjaron Otokastadion Schytlobud-1 2-0 Rīgas FS 25 augustus Ramat Hasjaron 1-0 Schytlobud-1 SFK 2000 3-0 Rīgas FS 28 augustus Rīgas FS 0-4 Ramat Hasjaron Schytlobud-1 2-2 SFK 2000 Asim Ferhatović Hasestadion
Groep 7 De wedstrijden werden gespeeld in het Waterford Regional Sports Centre te Waterford en in het Ferrycarrig Park te Wexford , Ierland .
# Club W G V Pnt V-T 1 BIIK Kazygurt3 0 0 9 11-1 2 Gintra Universitetas2 0 1 6 10-8 3 Wexford Youths 1 0 2 3 0 5-84 ARF Criuleni0 0 3 0 0 2-11
Uitslagen 23 augustus Gintra Universitetas 13-0 ARF Criuleni Waterford Regional Sports Centre BIIK Kazygurt 3-1 Wexford Youths Ferrycarrig Park 25 augustus BIIK Kazygurt 2-0 ARF Criuleni Waterford Regional Sports Centre Wexford Youths 1-2 Gintra Universitetas Ferrycarrig Park 28 augustus Gintra Universitetas 0-3 BIIK Kazygurt Waterford Regional Sports Centre ARF Criuleni 0-0 Wexford Youths Ferrycarrig Park
Groep 8 De wedstrijden werden gespeeld in het Myyrmäenstadion te Vantaa en in het Sonerastadion te Helsinki , Finland .
Uitslagen 23 augustus Avaldsnes IL 11-0 Newry City Myyrmäenstadion PK-35 Vantaa 1-2 CF Benfica 25 augustus CF Benfica 1-6 Avaldsnes IL PK-35 Vantaa 2-0 Newry City 28 augustus Avaldsnes IL 2-0 PK-35 Vantaa Newry City 0-5 CF Benfica Sonerastadion
Groep 9 De wedstrijden werden gespeeld op het Sportpark De Peuverweide te Geesteren en op het Sportpark Vondersweijde te Oldenzaal , Nederland .
Uitslagen 23 augustus FC Twente 2-1 Ferencvárosi TC De Peuverweide Konak Belediyespor 5-0 Hibernians FC Vondersweijde 25 augustus FC Twente 9-0 Hibernians FC De Peuverweide Ferencvárosi TC 2-0 Konak Belediyespor Vondersweijde 28 augustus Hibernians FC 0-4 Ferencvárosi TC De Peuverweide Konak Belediyespor 2-6 FC Twente Vondersweijde
Zestiende finale In deze ronde kwamen 23 teams voor het eerst in actie tezamen met de negen groepswinnaars van de voorronde. De loting vond plaats op 1 september 2016. De heenwedstrijden werden op 5 en 6 oktober gespeeld, de terugwedstrijden op 12 en 13 oktober.
Club Uitslagen Club Avaldsnes IL2-5, 0-5 Olympique Lyon Lillestrøm SK 3-1, 1-4 Paris Saint-Germain Manchester City WFC 2-0, 4-0 Zvezda 2005 Perm FK Minsk 0-3, 1-2 FC Barcelona Chelsea LFC 0-3, 1-1 VfL Wolfsburg Hibernian FC 0-6, 1-4 Bayern München Athletic Bilbao 2-1, 1-3 nv Fortuna Hjørring Breiðablik 0-1, 0-0 FC Rosengård Sturm Graz 0-6, 0-3 FC Zürich BIIK Kazygurt 3-1, 1-1 AGSM Verona SKN Sankt Polten 0-2, 2-2 Brøndby IF FC Twente 2-0, 3-1 AC Sparta Praag Eskilstuna United 1-0, 2-1 Glasgow City FC SFK 20000-0, 1-2 FC Rossiyanka KKPK Medyk Konin4-3, 2-3 (u ) ACF Brescia Apollon Limasol 1-1, 2-3 SK Slavia Praag
Achtste finale De loting vond plaats op 17 oktober 2016. De heenwedstrijden werden op 9 en 10 november gespeeld, de terugwedstrijden op 16 en 17 november.
Kwartfinale De loting vond plaats op 25 november 2016. De heenwedstrijden werden op 22 en 23 maart gespeeld, de terugwedstrijden op 29 en 30 maart.
Have finale De loting vond plaats op 25 november 2016. De heenwedstrijden werden op 22 en 23 april gespeeld, de terugwedstrijden op 29 en 30 april.
Finale De finale werd gespeeld op 1 juni in het Cardiff City Stadium te Cardiff , Wales .