Varian Gamma SARS-CoV-2
Varian Gamma SARS-CoV-2, juga dikenal sebagai garis keturunan P.1, 20J/501Y.V3, atau VOC-202101/02,[2] adalah varian dari SARS-CoV-2, virus yang menyebabkan Covid-19.[3] Varian ini termasuk varian yang dianggap penting.
![Negara-negara dengan kasus terkonfirmasi varian Gamma per 21 April 2021[1] Legenda: 1.000+ kasus terkonfirmasi 500–999 kasus terkonfirmasi 100–499 kasus terkonfirmasi 2–99 kasus terkonfirmasi 1 kasus terkonfirmasi Tidak ada atau tiada data](http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/c/cf/Lineage_P.1_sequences_by_country_as_of_21_April_2021.svg/350px-Lineage_P.1_sequences_by_country_as_of_21_April_2021.svg.png)
Legenda:
Bagian dari seri artikel mengenai |
Pandemi Covid-19 |
---|
![]() |
|
![]() |
Organisasi Kesehatan Dunia (WHO) melabeli varian ini sebagai varian Gamma bukan untuk menggantikan nama ilmiah, melainkan sebagai nama yang dipakai secara umum di ruang publik.[4] WHO menganggapnya sebagai varian yang diwaspadai (variant of concern).[5]
Penemuan
Varian ini pertama kali ditemukan oleh Institut Penyakit Menular Nasional (NIID) Jepang pada 6 Januari 2021 dalam empat orang yang tiba di Tokyo yang telah berkunjung ke Amazonas, Brazil, empat hari yang lalu.[6][7] Varian ini kemudian dinyatakan merebak di Brazil.[6] Yayasan Oswaldo Cruz yang dijalankan negara Brasil mengonfirmasikan keyakinannya bahwa varian tersebut telah menyebar di hutan hujan Amazon[8] dan telah beredar di sana sejak Juli 2020.[9]
Sifat
Transmisi
Pusat Penemuan, Diagnosis, Genomik, dan Epidemiologi Arbovirus (CADDE) mengeluarkan artikel jurnal tentang sampel yang dikumpulkan dari Manaus antara November 2020 dan Januari 2021. Penelitian ini menunjukkan bahwa varian ini (P.1) sekitar 2,0 kali lipat (1,7–2,4 kali lipat) lebih menular dan terbukti mampu menghindari sekitar 32 persen (21–46 persen) kekebalan dari infeksi koronavirus sebelumnya sehingga memungkinkan terjadi reinfeksi. Peningkatan juga tampak pada tingkat kematiannya. Varian ini sekitar 50 persen (20–90 persen) lebih mematikan.[10][11][12]
Mutasi
Gen | Nukleotida | Asam amino |
---|---|---|
ORF1a | S1188L | |
K1795Q | ||
S3675hapus | ||
G3676hapus | ||
F3677hapus | ||
ORF1b | P314L | |
E1264D | ||
Bulir | L18F | |
T20N | ||
P26S | ||
D138Y | ||
R190S | ||
K417T | ||
E484K | ||
N501Y | ||
D614G | ||
H655Y | ||
T1027I | ||
V1176F | ||
ORF3a | S253P | |
ORF8 | E92K | |
N | P80R | |
R203K | ||
G204R | ||
Sumber: Faria dkk. (2021),[6] CoVariants[13] | ||
Catatan: N501Y berarti perubahan dari asparagina (N) menjadi tirosina (Y) pada posisi asam amino 501.[14] |
Mutasi pada SARS-CoV-2 cukup sering: lebih dari empat ribu mutasi telah dideteksi hanya pada bulir proteinnya menurut Konsorsium Britania Raya untuk Genom COVID-19.[15]
Varian ini terdiri dari 35 mutasi: 21 mutasi tak bersinonim, 3 mutasi hapus, 1 mutasi sisipan, dan 10 mutasi bersinonim,[6] yaitu 25 mutasi yang mengubah protein dan 10 mutasi yang tidak berdampak.[16]
Efikasi vaksin
Seiring keberjalanan penelitian, kemampuan varian ini dalam menetralkan antibodi telah dievaluasi oleh ilmuwan dalam karya pracetak yang menunjukkan bahwa delapan orang yang telah diimunisasi oleh CoronaVac memiliki plasma darah yang kurang tanggap terhadap varian ini (P.1). Karena penelitian ini hanya memiliki partisipan sedikit, tidak dimungkinkan pembuatan kesimpulan statistik karena butuh lebih banyak partisipan.[17] Para ilmuwan dari MIT, Harvard, dan Cambridge serta paramedis rumah sakit di Boston membenarkan bahwa orang-orang yang telah divaksinasi dengan Pfizer–BioNTech atau Moderna mengalami penurunan neutralisasi secara signifikan terhadap P.1.[18]
Statistik
Kasus per negara (diperbarui 26 Juli 2021) GISAID [19] | ||
---|---|---|
Negara | Kasus terkonfirmasi | Kasus terakhir yang dilaporkan |
Amerika Serikat | 21.144 | 29 Juni 2021 |
Brasil | 12.456 | 13 Juni 2021 |
Kanada | 8.481 | |
Belgia | 1,518 | 1 Juli 2021 |
Meksiko | 1.285 | 24 Juni 2021 |
Chili | 2.149 | 13 Juni 2021 |
Spanyol | 786 | 26 Juni 2021 |
Italia | 551 | 29 Juni 2021 |
Belanda | 518 | 17 Juni 2021 |
Kolombia | 316 | 1 Juni 2021 |
Jerman | 312 | 22 Juni 2021 |
Prancis | 289 | 23 Juni 2021 |
Trinidad dan Tobago | 250 | 15 Juni 2021 |
Argentina | 236 | 12 Mei 2021 |
Guyana Prancis | 225 | 11 Juni 2021 |
Inggris Raya | 200 | 23 Juni 2021 |
Portugal | 176 | 23 Juni 2021 |
Uruguay | 171 | 15 April 2021 |
Swiss | 162 | 21 Juni 2021 |
Aruba | 116 | 20 Juni 2021 |
Jepang | 108 | 13 Juni 2021 |
Suriname | 108 | 25 Mei 2021 |
Swedia | 70 | 14 Juni 2021 |
Paraguay | 53 | 4 Mei 2021 |
Denmark | 49 | 29 Juni 2021 |
Haiti | 47 | 20 Mei 2021 |
Luksemburg | 47 | 21 Mei 2021 |
Ekuador | 36 | 18 Juni 2021 |
Kosta Rika | 32 | 21 Mei 2021 |
Irlandia | 27 | 27 Mei 2021 |
Peru | 25 | 22 Februari 2021 |
Austria | 24 | 10 Juni 2021 |
Malta | 24 | 21 Juni 2021 |
Turki | 23 | 29 Maret 2021 |
Bolivia | 17 | 2 Juni 2021 |
Venezuela | 17 | 26 Mei 2021 |
Republik Ceko | 13 | 9 Juni 2021 |
Republik Dominika | 12 | 10 Juni 2021 |
Israel | 11 | 16 Mei 2021 |
Singapura | 8 | 11 Juni 2021 |
Australia | 7 | 25 April 2021 |
Selandia Baru | 7 | 31 Mei 2021 |
Norwegia | 7 | 15 Juni 2021 |
Polandia | 7 | 19 Juni 2021 |
Kuwait | 6 | 19 Januari 2021 |
Afrika Selatan | 6 | 28 Desember 2020 |
Curacao | 6 | 28 Mei 2021 |
Rumania | 6 | 25 Mei 2021 |
Yordania | 5 | 28 April 2021 |
Slovenia | 4 | 31 Mei 2021 |
Taiwan | 4 | 28 Januari 2021 |
Lituania | 3 | 31 Mei 2021 |
Korea Selatan | 3 | 3 April 2021 |
Cina | 2 | 17 April 2021 |
Kroasia | 2 | 19 April 2021 |
DR Kongo | 2 | 12 Februari 2021 |
Finlandia | 2 | 23 Mei 2021 |
Bangladesh | 1 | 18 Februari 2021 |
Barbados | 1 | 22 Mei 2021 |
Kepulauan Cayman | 1 | 17 Juni 2021 |
Kepulauan Faroe | 1 | 12 Januari 2021 |
Guam | 1 | 30 April 2021 |
Guyana | 1 | 18 Januari 2021 |
Filipina | 1 | 21 Februari 2021 |
Puerto Riko | 1 | 9 Juni 2021 |
Liberia | 1 | 20 Juni 2021 |
Ghana | 1 | 15 April 2021 |
Papua Nugini | 1 | 5-7 April 2021 |
Arab Saudi | 1 | 31 Januari 2021 |
Dunia (69 negara) | Jumlah: '51 557 ' | Total per 22 Juli 2021 |
Penyebaran
Per 4 Juli 2021, tidak ada kasus varian Gamma di Indonesia.