A pécsi3-as jelzésű autóbuszMegyer, Kertváros és a belváros kapcsolatát látja el. A járat eredeti feladata a régi kertvárosi rész, a családi házas övezet ellátása volt, ám mióta átadásra került az új kertvárosi végállomás, Pécs egyik legforgalmasabb hurokjárata lett. A vonal meghosszabbításra került, két igen fontos megállóval lett gazdagabb. A végállomásról elindulva 14 perc alatt éri el a távolsági autóbusz-állomást, innen továbbhalad az Árkád megálló felé, majd érintve Főpályaudvart az eredeti útvonalon visszatér Kertvárosba. A járat 38 perc alatt teszi meg a 13,2 km-es kört.
1962. július 5-én indult az első, a jelenlegi 3-as vonalára leginkább hasonlító járat Kertváros irányába. Ez a járat a Széchenyi tértől indult 39-es jelzéssel, az Árnyas utca és a Táncsics Mihály utca kereszteződésénél volt a végállomása. 1968. december 19-én a kibővített vásártéri végállomásra helyeződött át a 39-es busz célállomása.
1976. augusztus 22-től a járat ismét új végállomásra költözött, amely Maléter Pál út 1 házszám alatt volt található. A járat a jelenlegi útvonalán közlekedett már akkor is, 1987. január 1-ig, mikor is az új számozási rendszer keretén belül kapta máig is érvényes 3-as jelzését, a belvárosban az óramutató járásával ellentétes kört írt le. 1987-től az óramutató járásával megegyezőre változott a kör: a Bőrgyár után lekanyarodott a hídról, először érintette a Főpályaudvart, és utána ment fel Rákóczi útra. Onnan le az Autóbusz-állomáshoz, és az eredeti útvonalon vissza.
2006. szeptember 1-jétől a járat végállomása megváltozott, az összevont kertvárosi végállomásra került, amely a Sztárai Mihály úton található. Ekkortól kezdve 2013. június 17-ig a járat ismét 1987 előtti útvonalon jár a Belvárosban. Azonban 2013. június 17.-én visszaállt az 1987 és 2006 közötti rend, vagyis a járatok előbb érintik a Főpályaudvart és csak utána az Árkádot.
Útvonala
Kertváros → Árkád → Kertváros
Kertváros – Sztárai Mihály út – Nagy Imre út – Keszüi út – Táncsics Mihály utca – Siklósi út – Árpád híd – Alsómalom utca – Ipar utca – Vasút utca – Indóház tér – Szabadság utca – Rákóczi út – Alsómalom utca – Alsómalom utca – Árpád híd – Siklósi út – Táncsics Mihály utca – Keszüi út – Nagy Imre út – Sztárai Mihály út – Kertváros