C'est cependant la 51e fois que le titre de champion du Salvador est remis en jeu.
Lors de ce tournoi, le CD Águila a tenté de conserver son titre de champion du Salvador face aux neuf meilleurs clubs salvadoriens.
Chacun des dix clubs participant était confronté deux fois aux neuf autres équipes. Puis les quatre meilleurs se sont affrontés lors d'une phase finale à la fin du tournoi.
Le tournoi Clausura se déroule de la même façon que le tournoi saisonnier précédent, en deux phases :
La phase de qualification : les dix-huit journées de championnat.
La phase finale : les matchs aller-retour allant des demi-finales à la finale.
Phase de qualification
Lors de la phase de qualification les dix équipes affrontent à deux reprises les neuf autres équipes selon un calendrier tiré aléatoirement.Les quatre meilleures équipes sont qualifiées pour les demi-finales.
Le classement est établi sur le barème de points classique (victoire à 3 points, match nul à 1, défaite à 0).Le départage final se fait selon les critères suivants :
(C) : Vainqueur d'un des deux tournois de l'année (P) : Promu de la saison 1998-1999
La phase finale
Les quatre équipes qualifiées sont réparties dans le tableau final d'après leur classement général.
Pour les demi-finales, en cas d'égalité sur la somme des deux matchs, c'est l'équipe la mieux classée qui est déclarée vainqueur. Lors de la finale des prolongations puis séance de tirs au but ont éventuellement lieu.