بیماریهای قارچی گیاهی بخش عمده بیماریهای گیاهی را تشکیل میدهند. ارگانیسمهای قارچی و شبه قارچی در مجموع بیش از ۸۰۰۰ گونه هستند که سبب بیماریهای قارچی گیاهی میشوند. ارگانیسمهای شبه قارچی شامل فیتیوم و فیتوفتورا (به انگلیسی: Phytophthora)هستند[۱].
یکی از تفاوتهای عوامل بیماری زای قارچی در برابر باکتری و ویروس آن است که قارچها علاوه بر نفوذ از طریق زخم روی گیاه یا روزنها دیگر موجود، با تولید ساختار ویژه هیفآپرسوریم (به انگلیسی: Appressorium) میتوانند مستقیماً وارد بافت گیاهی شوند.