Ensüümiklasside nomenklatuur
Ensüümiklasside nomenklatuur ehk Ensüümide nomenklatuur ehk Ensüümide nimestik on Ensüümikomisjoni poolt koostatud ensüümide nomenklatuur.[1]
Funktsioonid
Ensüümiklasside nomenklatuuri koostamine ja ensüümide ning koensüümide klassifitseerimine, samuti ensüümide sümbolitega seonduv ning ensüümide aktiivsuse ja ensüümikineetika mõõtmise ja kirjeldamise metoodika koostamine.[2][3][4]
Süstemaatika
Ensüümikomisjoni raportite alusel jagatakse ensüümid, soovituslikult, katalüüsitavate reaktsioonide alusel kuude klassi.
Ensüümide klassid
Klassid on ensüümide nomenklatuuris ära toodud numbritega EC. 1 – EC. 6:[5][6] (EC tähistab ingliskeelseid sõnu Enzyme Commission)
Ensüümide klassid inimkeha biokeemiliste reaktsioonide kaudu
| Klassi number | Süstemaatiline nimetus | Mõningate alaklasside triviaalnimetused |
|---|---|---|
| EC 1. | Oksüdoreduktaasid | dehüdrogenaasid, oksügenaasid, oksüdaasid, katalaasid, peroksüdaasid, reduktaasid |
| EC 2. | Transferaasid | aminotransferaasid, atsüültransferaasid, glükosüültransferaasid, kinaasid |
| EC 3. | Hüdrolaasid | desaminaasid, esteraasid, fosfataasid, fosfolipaasid, peptidaasid, ribonukleaasid |
| EC 4. | Lüaasid | aldolaasid,dehüdrataasid, dekarboksülaasid, hüdrataasid, süntaasid |
| EC 5. | Isomeraasid | epimeraasid,isomeraasid, ratsemaasid |
| EC 6. | Ligaasid | karboksülaasid, süntetaasid |
Alaklassid
Klassid jagatakse ensüümide nomenklatuuris alaklassidesse, mida tähistatakse numbritega 1-99-ni, näit
- EC 3.4. näitab ära klassi alaklassi;
Ala-alaklassid
- EC 3.4.13. näitab ära ala-alaklassi dipeptidaasid, toime peptiidsidemete kaudu;
Üksikensüüm
Viimane number ensüümide neljanumbrilises koodis näitab ära üksikensüümi järjekorranumbri ala-alaklassi kuuluvuse alusel, näiteks üksikensüüm
- EC 3.4.13.4 Xaa-Arg-dipeptidaas
Üksikensüümide loetelu täieneb pidevalt.
Andmebaasid
Ensüümiklasside jaotus ning liikmed ja nende toime ja organismid ning geenid on ära toodud ka erinevates andmebaasides nagu NC-IUBMB, BRENDA[7], EXPASY[8], KEGG[9], Metacyc[10] jpt.[11]
Ajaloolist
Viited
Välislingid
- NC-IUBMB. "Nomenclature Committee of the International Union of Biochemistry and Molecular Biology". Report from the introduction to Enzyme Nomenclature Historical Introduction, Veebiversioon (vaadatud 23.05.2013)
- Veebiversioon (vaadatud 23.05.2013) Ensüümide Nomenklatuur