La temporada 1986-87 fue la edición número XLVI del campeonato de liga de la Primera División, en la denominada "época profesional" del fútbol mexicano. Se regresó al formato de torneos largos tras la finalización del mundial en México, luego de una temporada en la que se celebraron dos torneos cortos. Guadalajara conquistó su primer título disputando una liguilla, siendo este el noveno campeonato en la historia del conjunto tapatío, tras 17 años sin ganar un torneo de liga, y finalizando como líder general de la competencia, un punto encima de Cruz Azul, que se quedaría con el segundo puesto.
La final tuvo el distintivo enfrentamiento entre los hermanos Marco Antonio y Guillermo Mendizábal, tras la elección y regreso de este último al fútbol mexicano con Guadalajara. Por su parte, Cruz Azul llegó al juego de vuelta con la baja de cinco jugadores, incluido su capitán Ignacio Flores, quien se desgarró en el primer partido (2-1), donde anotó desde los once pasos, y no pudo liderar al equipo en Jalisco (3-0).
Ascendió como campeón de la Segunda División el Cobras de Querétaro, que ocupó la vigesimoprimera plaza en el máximo circuito (se jugó con 21 equipos, tras la suspensión el descenso en el ciclo 1985-86 por la celebración de los dos torneos cortos); sin embargo, terminó descendiendo de categoría al terminar el certamen, junto a León, en los últimos lugares de la tabla general. Se optó por un descenso doble, para regresar a veinte el número de equipos en el máximo circuito.[1][2][3][4][5]
Los veinte participantes fueron divididos en cuatro grupos de cinco equipos cada uno; todos disputaron la fase regular bajo un sistema de liga, es decir, todos contra todos a visita recíproca; con un criterio de puntuación que otorga dos puntos por victoria, uno por empate y cero por derrota.
Clasificaron a la disputa de la fase final el primer y segundo lugar de cada grupo (sin importar su ubicación en la tabla general). Los equipos clasificados son ubicados del 1 al 8 en duelos cruzados (es decir 1 vs 8, 2 vs 7, 3 vs 6 y 4 vs 5), se enfrentaban en rondas ida-vuelta o eliminación directa.
La definición de los partidos de fase final tomarían como criterio el "gol de visitante", es decir, el equipo que en la serie ida y vuelta, anotará más goles en calidad de visitante. Se procedería a tiempo extra y tiros de penal en caso de tener la misma cantidad de goles en ambos partidos; los goles en tiempo extra no eran válidos para el criterio de gol de visitante, en virtud de la justicia deportiva que debía imperar, ya que en una serie a visita recíproca, solo los juegos de vuelta tienen tiempos extras.
En la definición del descenso, se determinó que los dos clubes con menos puntos descenderán automáticamente a segunda división, con el objetivo de retomar la cantidad de 20 equipos en la máxima categoría. Los criterios de desempate para definir todas las posiciones serían la diferencia de goles entre tantos anotados y los recibidos, después se consideraría el "goal average" o promedio de goles, y finalmente la cantidad de goles anotados.[6]