Caliciviridae

Die kugelförmigen Viruspartikel der Caliciviridae erscheinen bei Negativkontrastierung im TEM etwa 27 bis 40 nm im Durchmesser groß (Bild rechts mit 50-nm-Markierung), im Kryoelektronenmikroskop 35 bis 40 nm. Bei der Abbildung im TEM zeigen die Caliciviren eine kleine, kelchförmige Eindellung, von der sie ihren Namen erhielten (lat. calix: Becher, Pokal). Die Partikel sind unbehüllte Kapside, die aus 90 Dimeren des Haupt-Strukturproteins aufgebaut sind. Sie zeigen eine ikosaedrische T=3 Symmetrie.

Genom der Caliciviride
(prinzipieller Aufbau)

Genom einiger Vertreter der Caliciviridae

Das Genom der Caliciviridae ist monopartit (nicht-segmentiert) und besteht aus einem linearen ssRNA-Molekül positiver Polarität. Seine Größee beträgt 7,3 bis 8,3 kb (Kilobasen). Das 5'-Ende ist an ein VPg-Protein gebunden und das 3'-Ende ist polyadenyliert.^[3]

• Familie Caliciviridae
  • Genus Bavovirus^[4] (Hühner)
    • Spezies Bavaria virus (alias Hühner-Calicivirus)
  • Genus Lagovirus^[5]
    • Spezies Rabbit Hemorrhagic Disease Virus
    • Spezies European brown hare syndrome virus
  • Genus Minovirus^[6]
    • Spezies Minovirus A (veraltet Fathead minnow calicivirus, FHMCV, Amerikanische Dickkopfelritze Pimephales promelas)
  • Genus Nacovirus^[7] (Hühner und Truthühner)
  • Genus Nebovirus (früher Becovirus, Nabovirus, Bovines Entero-Calicivirus, en. Bovine enteric calcivirus, Enteropathogenic bovine calicivirus)^[8][9][10]
    • Spezies Newbury-1-Virus (englisch Newbury 1 virus)
      • Stamm NB
    • Spezies „Kırklareli Virus“^[11]
  • Genus Norovirus^[12]
    • Spezies Norwalk-Virus (NoV, 7 Genotypen)
  • Vorläufige Spezies des Genus Norovirus:
    • Spezies „Bovines Norovirus-CH126“
    • Spezies „Bovines Norovirus-Jena“ (kurz „Jena virus“)
    • Spezies „Humanes Norovirus-Alphatron“
    • Spezies „Humanes Norovirus Saitama“
    • Spezies „Murines Norovirus 1“
    • Spezies „Porcines Norovirus“ (Norovirus des Schweines)
    • Spezies „Norovirus der Auster“
  • Genus Recovirus (Rhesus enteric calicivirus, in Stuhlproben von Rhesusaffen nachgewiesen)^[13][14]
    • Spezies Recovirus A^[15]
      • Stamm Tulane-Virus (TV)^[15][16]
  • Genus Salovirus^[17] (Atlantischer Lachs Salmo salar)
  • Genus Sapovirus^[18][12]
    • Spezies Sapporo-Virus (SaV, 6 Genotypen)
  • Vorläufige Spezies des Genus Sapovirus:
    • Spezies „Porcines Entero-Sapovirus“ (Cowden)
    • Spezies „Nerz-Entero-Sapovirus“
  • Genus Valovirus^[19][20]
    • Spezies St-Valerien-Schweine-Virus englisch Saint Valerien virus, veraltet St-Valérien-like virus, SVV, bei Schweinen^[21][22]
  • Genus Vesivirus^[23]
    • Spezies Felines Calicivirus (en. Feline calicivirus, 2 Genotypen)
    • Spezies Vesikulärexanthem-Virus (en. Vesicular exanthema of swine virus, VEV oder VESV, Typusspezies), urspr. Erkrankung beim Schwein mit bislang 9 Stämmen (Subspezies):
      • Subspezies Bovines Calicivirus
      • Subspezies Wal-Calicivirus
      • Subspezies Primaten-Calicivirus
      • Subspezies Reptilien-Calicivirus
      • Subspezies San-Miguel-Seelöwenvirus (SMSV) Serotypen 1, 4, 17
      • Subspezies Calicivirus des Stinktieres
      • Subspezies Vesikulärexanthem-Virus Serotyp A48
    • Vorläufige Spezies der Gattung Vesivirus:
      • Spezies „Nerz-Calicivirus“
      • Spezies „Canines Calicivirus“
      • Spezies „Walross-Calicivirus“
• Vorläufige – mit Stand März 2019 noch nicht vom ICTV bestätigte – Gattungen:
  • Genus „Sanovirus“^[24]
    • Spezies „Gänse-Calicivirus“
  • Genus „Secalivirus“^[25]
    • Spezies „Sewage associated calici-like virus“ (SecaliV, gefunden im Abwasser, englisch sewage)
• Weitere vorgeschlagene Spezies innerhalb der Familie Calciviridae ohne Genuszuordnung (Auswahl):
  • „Fledermaus-Calicivirus“ (englisch „Bat calcivirus“)^[26]

Für die innere Systematik gibt es verschiedene Vorschläge. Gemeinsamkeit ist, dass sich die Calciviridae in zwei Hauptgruppen teilen:^[27]

• „Sapovirus-Gruppe“: Genera Lagovirus, Nebovirus, Vesivirus und Sapovirus (mut typischem Aussehen der Virionen)
• „Norovirus-Gruppe“: Genus Norovirus zusammen mit weiteren vorgeschlagenen Genera (mit kleinen, rundlichen, strukturierten Virionen)

Das folgende Kladogramm basiert auf dem Vorschlag von Siqueira et al. (2018),^[28] ergänzt durch vorgeschlagene Genera nach Mikalsen et al. (2014):^[29]

Teilweise abweichende Vorschläge – ohne Berücksichtigung der puativen Gattungen – findet man in älteren Veröffentlichungen wie z. B.:

• Ian N. Clarke et al. (2017)^[30]
• Ian N. Clarke et al. (2012)^[31]
• Scipioni et al. (2008)^[8]
• Espinosa et al. (2004)^[32] – keine Abweichung zu Siqueira et al. (2018)

Koonin et al. haben 2015 die Caliciviridae taxonomisch (aufgrund ihrer Verwandtschaft) einer von ihnen postulierten Supergruppe „Picornavirus-like superfamily“ zugeordnet.^[33]Die Mitglieder dieser vorgeschlagenen Supergruppe gehören verschiedenen Gruppen der Baltimore-Klassifikation an, in der Regel handelt es sich um einzelsträngige RNA-Viren positiver Polarität ((+)ssRNA, Baltimore-Gruppe 4), es sind aber auch – wie die Birnaviridae – doppelsträngige Vertreter (mit dsRNA gekennzeichnet, Baltimore-Gruppe 3) zu finden.Dieser Vorschlag ist inzwischen abgelöst durch die Master species List #35 des ICTV vom März 2020^[34] Eine Gegenüberstellung der Kladogramme findet sich bei Picornavirales §ICTV Master Species List #35.

• K. Y. Green, R. M. Chancock und A. Z. Kapikian: Human caliciviruses. In: David M. Knipe, Peter M. Howley et al. (Hrsg.): Fields’ Virology. 4. Auflage. Philadelphia 2001, ISBN 978-0-7817-1832-5.
• C. M. Fauquet, M. A. Mayo et al.: Eighth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses. London / San Diego, 2005, Family Caliciviridae S. 843–851.

• The Calcivirus Pages: Calciviridae. The Pirbright Institute (UK), 2006–2017.