UNKL
Neuređeni RING protein cinkovog prsta je protein koji je kod ljudi kodiran genom UNKL.[5]
Patricia Hartz (2017) mapirala je gen UNKL u hromosomskoj regiji 16p13.3, na osnovu poravnanja UNKL sekvence (GenBank AK022685) sa genomskom sekvencom (GRCh38).
Kloniranje i ekspresija
Korištenje aktiviranog mutanta RAC1 kao sonde u 2-hibridnom skriningu Jurkat biblioteke cDNK ljudskih T-ćelija, nakon čega je uslijedilo nekoliko rundi 5-baznog RACE-a s leukocitima ljudske periferne krvi, Lores et al. (2010) klonirali UNKL, koji su nazvali UNKL. Izvedeni protein s 680 aminokiselina ima ćetiri cinkova prsta u N-terminalnom području i domenu prstenastih prstiju blizu C-kraja. UNKL ima 87%, odnosno 40% identiteta sa ortolozima miša i roda Drosophila. Northern blot analiza otkrila je sveprisutnu ekspresiju transkripta od 4,4 kb u tkivima miša. Epitop označen UNKL bio je pretežno lociran u citosolu transficiranih HeLa ćelija, ali inhibicija eksporta jedarne energije rezultirala je jedarnom akumulacijom UNKL.[6]
Funkcija gena
Primjenom GST padajućeg test, Lores et al. (2010) potvrdili su interakciju između aktiviranog RAC-a i izoliranog C-terminala ljudskog UNKL-a, uključujući RING domen cinkovog prsta. Krajnji dio UNKL C nije stupio u interakciju sa RAC1 pune dužine, koji je pretežno bio u obliku vezanom za BDP, niti sa bilo kojom drugom testiranom malom GTPazom. C-terminalna regija UNKL-a bila je ubikvitinirana u nekoliko ljudskih ćelijskih linija, a ubikvitinacija je pojačana aktiviranim RAC1. Delecija RING domena mišjeg cinkocog prsta Unkl poboljšala je njegovu sveprisutnost. C-terminalno područje UNKL-a stupilo je u interakciju sa SWI/SNF-om podjedinicom kompleksa za preoblikovanje hromatina BAF60B, u 2-hibridnoj analizi biblioteke cDNK posteljice. UNKL nije komunicirao s drugim ispitivanim podjedinicama BAF-a. Ekspresije regijw C-terminala UNKL poboljšale je ubikvitinaciju BAF60B, a kratko razlaganje UNKL-a posredovano ukosnicama smanjilo je ubikvitinaciju BAF60B.
Aminokiselinska sekvenca
Dužina polipeptidnog lanca je 680 aminokiselina, a molekulska težina 73.828 Da.[7].
- Simboli
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MPSVSKAAAA | ALSGSPPQTE | KPTHYRYLKE | FRTEQCPLFS | QHKCAQHRPF | ||||
TCFHWHFLNQ | RRRRPLRRRD | GTFNYSPDVY | CSKYNEATGV | CPDGDECPYL | ||||
HRTTGDTERK | YHLRYYKTGT | CIHETDARGH | CVKNGLHCAF | AHGPLDLRPP | ||||
VCDVRELQAQ | EALQNGQLGG | GEGVPDLQPG | VLASQAMIEK | ILSEDPRWQD | ||||
ANFVLGSYKT | EQCPKPPRLC | RQGYACPHYH | NSRDRRRNPR | RFQYRSTPCP | ||||
SVKHGDEWGE | PSRCDGGDGC | QYCHSRTEQQ | FHPESTKCND | MRQTGYCPRG | ||||
PFCAFAHVEK | SLGMVNEWGC | HDLHLTSPSS | TGSGQPGNAK | RRDSPAEGGP | ||||
RGSEQDSKQN | HLAVFAAVHP | PAPSVSSSVA | SSLASSAGSG | SSSPTALPAP | ||||
PARALPLGPA | SSTVEAVLGS | ALDLHLSNVN | IASLEKDLEE | QDGHDLGAAG | ||||
PRSLAGSAPV | AIPGSLPRAP | SLHSPSSAST | SPLGSLSQPL | PGPVGSSAMT | ||||
PPQQPPPLRS | EPGTLGSAAS | SYSPLGLNGV | PGSIWDFVSG | SFSPSPSPIL | ||||
SAGPPSSSSA | SPNGAELARV | RRQLDEAKRK | IRQWEESWQQ | VKQVCDAWQR | ||||
EAQEAKERAR | VADSDRQLAL | QKKEEVEAQV | IFQLRAKQCV | ACRERAHGAV | ||||
LRPCQHHILC | EPCAATAPEC | PYCKGQPLQW |