S100B

S100 kalcij-vezujući protein B (S100B) jest član porodice S-100 proteina, koji je kod ljudi kodiran genom S100 sa hromosoma 21.

S100B
Dostupne strukture
PDBPretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova

1MQ1, 1UWO, 2H61, 2M49, 2PRU, 3CZT, 3D0Y, 3D10, 3HCM, 4XYN, 5CSJ, 5CSF, 5CSN, 5CSI

Identifikatori
AliasiS100B
Vanjski ID-jeviOMIM: 176990 MGI: 98217 HomoloGene: 4567 GeneCards: S100B
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 21 (čovjek)
Hrom.Hromosom 21 (čovjek)[1]
Hromosom 21 (čovjek)
Genomska lokacija za S100B
Genomska lokacija za S100B
Bend21q22.3Početak46,598,604 bp[1]
Kraj46,605,208 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 10 (miš)
Hrom.Hromosom 10 (miš)[2]
Hromosom 10 (miš)
Genomska lokacija za S100B
Genomska lokacija za S100B
Bend10 C1|10 38.76 cMPočetak76,089,687 bp[2]
Kraj76,096,993 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije
Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija calcium ion binding
S100 protein binding
protein homodimerization activity
vezivanje iona cinka
vezivanje iona metala
calcium-dependent protein binding
GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
vezivanje identičnih proteina
tau protein binding
signaling receptor binding
RAGE receptor binding
Ćelijska komponenta citoplazma
ruffle
extracellular region
neuronal cell body
perinuklearno područje citoplazme
jedro
Vanćelijsko
Biološki proces axonogenesis
response to glucocorticoid
Memorija
negative regulation of skeletal muscle cell differentiation
central nervous system development
astrocyte differentiation
positive regulation of synaptic transmission
positive regulation of cell population proliferation
regulation of cell shape
positive regulation of apoptotic process
learning or memory
positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling
regulation of neuronal synaptic plasticity
response to methylmercury
Ćelijska proliferacija
Urođeni imunski sistem
cellular response to hypoxia
long-term potentiation
positive regulation of myelination
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_006272

NM_009115

RefSeq (bjelančevina)

NP_006263

NP_033141

Lokacija (UCSC)Chr 21: 46.6 – 46.61 MbChr 10: 76.09 – 76.1 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

S100 proteini su nalaze se u citoplazmi i jedru širokog spektra ćelija i uključeni su u regulaciju brojnih ćelijskih procesa kao što su napredovanje ćelijskog ciklusa i ćelijska diferencijacija. S100 geni uključuju najmanje 13 članova koji su locirani kao klaster na hromosomskoj regiji 1q21; međutim, ovaj gen se nalazi na 21q22.3.

Aminokiselinska sekvenca

Dužina polipeptidnog lanca je 92 aminokiseline, a molekulska težina 10.713 Da.

1020304050
MSELEKAMVALIDVFHQYSGREGDKHKLKKSELKELINNELSHFLEEIKE
QEVVDKVMETLDNDGDGECDFQEFMAFVAMVTTACHEFFEHE

Funkcija

S100B je specifičan za gliju, eksprimiran prvenstveno putem astrocita, ali ga ne eksprimiraju svi astrociti. Pokazalo se da se S100B eksprimira samo podtipom zrelih astrocita koji pokrivaju krvne sudove i u čelijama koje eksprimiraju NG2.[5]

Ovaj protein može funkcionirati u proširenju neurita, proliferaciji ćelija melanoma, stimulaciji tokova Ca2+, inhibiciji PKC posredovane fosforilacije, astrocitoza, proliferacija aksona i inhibicija sklapanja mikrotubula. U razvoju centralnog nervnog sistema (CNS) djeluje kao neurotrofni faktor i protein za preživljavanje neurona. U odraslom organizmu obično je na povišenoj razini zbog oštećenja nervnog sistema, što ga čini potencijalnim kliničkim markerom.

Klinički značaj

Hromosomski preuređenje i izmijenjena ekspresije ovog gena su implicirani u nekoliko neuroloških, neoplazijskih i ostalih tipova bolesti, uključujući Alzheimerovu bolest, Downov sindrom, epilepsiju, amiotrofnu lateralnu sklerozu, švanom, melanom i dijabetes melitus tipa I.[6]

Sugerirano je da regulacija S100B pomoću melitina ima potencijal za liječenje epilepsije.[7]

Dijagnostička upotreba

S100B luče astrociti ili se može izliti iz ozlijeđenih ćelija i ući u vanćelijski prostor ili krvotok. Nivo S100B u serumu povećan je kod pacijenata tokom akutne faze oštećenja mozga. Tokom posljednje decenije, S100B se pojavio kao kandidat za periferni biomarker permeabilnosti krvno-moždane barijere (BBB) i povrede CNS-a. Povišeni nivoi S100B tačno odražavaju prisustvo neuropatoloških stanja uključujući traumatske povrede glave ili neurodegenerativne bolesti. Normalni nivoi S100B pouzdano isključuju velike patološke promjene CNS-a. Njegova potencijalna klinička upotreba u procesu donošenja terapijskih odluka potkrijepljena je ogromnom količinom literature koja potvrđuje varijacije u nivoima 100B u serumu sa standardnim modalitetima za prognozu obima oštećenja CNS-a: promjene u neurosnimcima, cerebrospinalnom pritisku i drugim molekulskim markerima mozga (neuronski specifična enolaza i glijski vlaknasti kiseli protein). Međutim, što je još važnije, zabilježeno je da se nivoi S100B povećavaju prije bilo kakvih uočljivih promjena unutarmoždanog peritiska, neurosnimanja i nalaza neurološkog skrininga. Dakle, glavna prednost upotrebe S100B je to što povišenje nivoa u serumu ili CSF-u pružaju osjetljivu mjeru za određivanje povrede CNS-a na molekulskm nivou prije nego što se razviju grube promjene, omogućavajući pravovremenu isporuku ključne medicinske intervencije prije nego što dođe do nepovratnog oštećenja. Prije napada, povišeni su nivoi S100B u serumu, što sugerira da bi curenje BBB moglo biti rani događaj u njegovom razvoju.[8]

Izuzetno važna primjena testiranja serumskog S100B je u odabiru pacijenata s lakšim ozljedama glave kojima nije potrebna daljnja neuroradiološka evaluacija, jer su studije koje su upoređivale CT skeniranje i nivoe S100B pokazale da su vrijednosti S100B ispod 0,12 ng/mL povezane s niskim rizikom očiglednih neuroradioloških promjena (kao što je intrakranijsko krvarenje ili oticanje mozga) ili značajnih kliničkih posljedica.[9] Odlična negativna prediktivna vrijednost S100B u nekoliko neuroloških stanja je zbog činjenice da serumski nivoi S100B odražavaju promjene permeabilnosti krvno-moždane barijere, čak i u odsustvu neuronske ozljede.[10][11]Osim toga, S100B, koji je također prisutan u ljudskim melanocitima, pouzdan je marker za zloćudnost melanoma, kako u biopsijskom tkivu tako i u serumu.[12][13]

Modelni organizmi

U proučavanju funkcije S100B korišteni su modelni organizmi. Uvjetna linija nokaut-miša, zvana S100btm1a(EUCOMM)Wtsi[14][15] generirana je kao dio Međunasrodnog konzorcija za nokaut-miševe— projekta mutageneze velike propusnosti za generiranje i distribuciju životinjskih modela bolesti zainteresovanim naučnicima — u Institutu Wellcome Trust Sanger.[16][17][18]

Fenotip S100b nokaut-miševa
SvojstvoFenotip
Vijabilnost homozigotaNormalan
PlodnostNormalan
Tjelesna težinaNormalan
Anksioznost otvorenog poljaNormalan
Neurološka procjenaNormalan
Snaga stiskaNormalan
Test vruće pločeNormalan
DismorfologijaNormalan
Posredna kalorimetrijaNormalan
Test tolerancije glukozeNormalan
Slušni odgovor moždanog stablaNormalan
DEXANormalan
RadiografijaNormalan
Tjelesna temperaturaNormalan
Morfologija okaNormalan
Klinička hemijaNormalan
HematologijaNormalan
Limfociti periferne krviNormalan
Mikronukleus testNormalan
Težina srcaNormal
Histopatologija mozgaNormalan
Salmonella infekcijaNormalan[19]
Citrobacter infekcijaNormalan[20]
Svi testovi i analize su prema:[21][22]

Male and female animals underwent a standardized phenotypic screen to determine the effects of deletion.[21][23] Obavljena su 23 testa na mutantnim miševima, ali još uvijek nisu uočene značajne abnormalnosti.[21]

Interakcije

Pokazalo se da S100B ima interakcije sa:

Reference

Dopunska literatura

Ovaj članak uključuje tekst iz Nacionalne medicinske biblioteke Sjedinjenih Država, koji je u javnom vlasništvu.