Proteinski dimer
Proteinski dimer – u biohemiji – je makromolekulski proteinski kompleks formiran od dva proteinska monomera ili pojedinačnih proteina, koji su obično ne kovalentno vezani. Mnoge makromolekule, kao što su proteini ili nukleinske kiseline, tvore dimere. Termin dimer ima korijene u značenju dva dijela: prefiks di– (=dva) + sufiks –mer (=dio, segnment). Proteinski dimer je tip kvaternarne strukture.
Proteinski homodimer čine dva identična proteina, a heterodimer – dva različita.
Većina proteinskih dimera u biohemiji nisu povezani kovalentnom vezom. Primjer nekovalentnog heterodimera je enzim reverzna transkriptaza, koji se sastoji od dva različita aminokiselinska lanca.[1] Izuzetak su dimeri koji su povezani disulfidnim mostom, poput homodimernog proteina NEMO.[2]
Neki proteini sadrže specijalizirane domene, kako bi osigurali dimerizaciju (domeni dimerizacije) i specifičnost.[3]
Primjeri
- Transkripcijski faktori
- 14-3-3 proteini
- Promjenjivi površinski glikoproteini parazita Trypanosoma
- Tubulin
- Neki faktori koagulacije krvi
- Neki receptori
- Jedarni receptor i
- G-protein spregnuti receptor
- G-protein dimerna βγ-podjedinica
- Receptor tirozin-kinaze
- Neki enzimi
- Tip II restrikcijskih enzima
- Triosefosfatizomeraza (TIM)
- Alkohol-dehidrogenaza
Alkalna fosfataza
Alkalna fosfataza E. coli, dimerni enzim, pokazuje integrinsku komplementaciju.[4] To znači, kada su kombinirane određene mutirane verzije alkalne fosfataze, heterodimerni enzimi nastali kao rezultat ispoljenog višeg nivoa aktivnosti nego što bi se očekivalo na osnovu relativnih aktivnosti roditeljskih enzima. Ova otkrića ukazuju da je dimerna struktura alkalne fosfataze E. coli omogućava kooperativne interakcije između sastavnih mutantnih monomera, koji mogu stvoriti funkcionalniji oblik holoenzima.
Također pogledajte
- Polimer
- Proteinski trimer
- Oligomer
- Proteinski kompleks