CACTIN

Kaktin, znan i kao bubrežni karcinomski antigen NY-REN-24 je protein koji je kod ljudi kodiran genom CACTIN.[5][6][7]

CACTIN
Identifikatori
AliasiCACTIN
Vanjski ID-jeviOMIM: 618536 MGI: 1917562 HomoloGene: 69553 GeneCards: CACTIN
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 19 (čovjek)
Hrom.Hromosom 19 (čovjek)[1]
Hromosom 19 (čovjek)
Genomska lokacija za CACTIN
Genomska lokacija za CACTIN
Bend19p13.3Početak3,610,645 bp[1]
Kraj3,626,815 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 10 (miš)
Hrom.Hromosom 10 (miš)[2]
Hromosom 10 (miš)
Genomska lokacija za CACTIN
Genomska lokacija za CACTIN
Bend10|10 C1Početak81,156,937 bp[2]
Kraj81,162,076 bp[2]
Ontologija gena
Molekularna funkcija GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
vezivanje sa RNK
Ćelijska komponenta catalytic step 2 spliceosome
nukleoplazma
spliceosomal complex
Egzosom
jedro
citosol
nuclear speck
citoplazma
Biološki proces GO:0033128 negative regulation of protein phosphorylation
mRNA splicing, via spliceosome
immune system process
negative regulation of type I interferon-mediated signaling pathway
cellular response to tumor necrosis factor
mRNA processing
negative regulation of interferon-beta production
negative regulation of lipopolysaccharide-mediated signaling pathway
multicellular organism development
negative regulation of interleukin-8 production
negative regulation of toll-like receptor signaling pathway
cellular response to interleukin-1
Prerada RNK
negative regulation of tumor necrosis factor production
Urođeni imunski sistem
cellular response to lipopolysaccharide
negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_001080543
NM_021231

NM_027381

RefSeq (bjelančevina)

NP_001074012
NP_067054

NP_081657

Lokacija (UCSC)Chr 19: 3.61 – 3.63 MbChr 10: 81.16 – 81.16 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Kaktin je negativni regulator urođene imunske signalizacije i funkcionalna komponenta mehanizma za preradu pre-iRNK

Kloniranje i ekspresija

SEREX-om (serološka analiza biblioteka ekspresije rekombinantne cDNK, skriningom biblioteka cDNK ljudskog karcinoma bubrega, Scanlan et sl. (1999) klonirali CACTIN, koji su označili kao NY-REN-24. RT-PCR analiza otkrila je ekspresiju kaktina u svih šest testiranih ljudskih tkiva: pluća, testisi, tanko crijevo, dojka, jetra i placenta Analiza sekvence sugerira da se CACTIN lokalizira u jedru.[8].[8]

Lin et al. (2000) kloniraki su kaktin Drosophila. Predviđeni protein kaktin Drosophila ima N-terminalni domen bogat napunjenim ostacima, tri potencijalna dvodijelna signala jedarne lokalizacije i tri domena sa spiralnom zavojnicom. Drozofilski kaktin dijeli 41% identiteta aminokiselina s predviđenim ljdskim proteinom CACTIN od 758 aminokiselina. CACTIN je konzerviran u biljkama i životinjama, a svi kaktinski ortolozi imaju visoko konzerviranu regiju u svojim C-terminalnim polovinama. Northern blot analiza pokazala je ekspresiju kaktina kod ženki roda Drosophila , ali samo slabu ekspresiju kod mužjaka. Kod ženki, kaktin je bio prisutan na relativno visokim nivoima u jajnicima i tokom embriogeneze.

Koristeći RT-PCR, Atzei et al. (2010) pokazali su da se kaktin sveprisutno eksprimirao u mozgu i perifernim organima miša Otkrili su i da je kaktin eksprimiran u svim fazama ranog embrionakog razvoja kod zebrica.[9]

Funkcija gena

Korištenjem 2-hibridnih analiza kvasca i koimunoprecipitacije, Lin et al. (2000) otkrili su da je kaktin komunicirao s kaktusom, ortologom I-kappa-B, kod drozofile. Prekomjerna ekspresija kaktina u heterozigotnim drosofilama za mutirani akt kaktin-A2 poboljšala je mutantni fenotip, sa snažnim povećanjem embrionske letalnosti i ventralizacije.[10]

Atzei et al. (2010) otkrili su da je prekomjerna ekspresija ljudskog CACTIN-a inhibirala ćelijsku aktivaciju NFKB, kao odgovor na proinflamatorne podražaje, dok ga je noktadn povećao. Slično tome, CACTIN negativno regulira TLR-posredovanu aktivaciju IRF3 i IRF7 i indukciju gena koji reagiraju na IRF. Analize koimunoprecipitacije i imunofluorescencije pokazale su da CACTIN nije komunicirao s citoplazmatskom IKBA (NFKBIA), već je kolokalizirao i interakciju sa nuklearnim IKBL (NFKBIL1), za koji je utvrđeno da inhibira aktivaciju puteva NFKB i IRF, izazvanih lipopolisaharidima. CACTIN bez svojihjedarnih lokalizacijskih sekvenci bio je isključen iz jdra, nije uspio stupiti u interakciju s IKBL i pokazao je znatno smanjene inhibitorne efekte na TLR signalizaciju.[11]

Suzuki i et al. (2016) otkrili su da su se ljudski CACTIN i TRIM39 (605700) izravno vezali i da je za interakciju potrebna domena B-boka TRIM39. Analiza frakcionacije u ćelijama HEK293T pokazala je da je CACTIN lokaliziran i na jedro i na citosol. TRIM39 je komunicirao s CACTIN-om uglavnom u jezgri kako bi ga stabilizirao na ubikvitinacijski neovisan način..[12]

Daljnje analize pokazale su da je CACTIN pružio petlju negativne povratne sprege u signalnom putu NFKB-a, jer je TRIM39 negativno regulirao aktivnost transkripcije posredovane NFKB-om stabilizirajući CACTIN. Analizom nokdauna, Zanini et al. (2017) pokazali su da je CACTIN bitan za potporu proliferaciji ćelija, stabilnost genoma, pravilni morfologiju jedra i segregaciju hromosoma u ljudskim ćelijama. Analiza sekvencirane RNK otkrila je defekte prerade na hiljadama pre-iRNK u ćelijama osiromašenim kaktinom. Konkretno, na preradu sororina (CDCA5) uticalo se u ćelijama osiromašenim kaktinom, što je rezultiralo akumulacijom neprerađenog pre-iRNK sororina. Ekspresija cDNK bez soroina u različitoj je mjeri obnovila nedostatke povezane sa iscrpljivanjem kactina, što ukazuje da je CACTIN podržavao normalnu koheziju i jrdarnu strukturu hromosoma, uglavnom promovirajući taču preradu pre-iRNK sororina. Masena spektrometrijska analiza i eksperimenti koimunoprecipitacije otkrili su da je CACTIN u fizičkoj i funkcionalnoj interakciji s DHX8 (600396) i SRRM2, vjerovatno u jedru, podržavajući mehanizme za preradu pre-iRNK.[8][12][13]

Aminokiselinska sekvenca

Simboli
1020304050
MGRDTRSRSRSAGRRGRRRQSQSGSRSRSRSHGRRNRRRREDEGRRRRRR
RSRERRSDSEEERWQRSGMRSRSPPRPKWHSRDGSSQSDSGEEQSRGQWA
RRRRRARSWSPSSSASSSASPGRSQSPRAAAAALSQQQSLQERLRLREER
KQQEELMKAFETPEEKRARRLAKKEAKERKKREKMGWGEEYMGYTNTDNP
FGDNNLLGTFIWNKALEKKGISHLEEKELKERNKRIQEDNRLELQKVKQL
RLEREREKAMREQELEMLQREKEAEHFKTWEEQEDNFHLQQAKLRSKIRI
RDGRAKPIDLLAKYISAEDDDLAVEMHEPYTFLNGLTVADMEDLLEDIQV
YMELEQGKNADFWRDMTTITEDEISKLRKLEASGKGPGERREGVNASVSS
DVQSVFKGKTYNQLQVIFQGIEGKIRAGGPNLDMGYWESLLQQLRAHMAR
ARLRERHQDVLRQKLYKLKQEQGVESEPLFPILKQEPQSPSRSLEPEDAA
PTPPGPSSEGGPAEAEVDGATPTEGDGDGDGEGEGEGEAVLMEEDLIQQS
LDDYDAGRYSPRLLTAHELPLDAHVLEPDEDLQRLQLSRQQLQVTGDASE
SAEDIFFRRAKEGMGQDEAQFSVEMPLTGKAYLWADKYRPRKPRFFNRVH
TGFEWNKYNQTHYDFDNPPPKIVQGYKFNIFYPDLIDKRSTPEYFLEACA
DNKDFAILRFHAGPPYEDIAFKIVNREWEYSHRHGFRCQFANGIFQLWFH
FKRYRYRR

Reference

Dopunska literatura